Quantitative Analyse von Protein-Massenspektren
Quantitative Analyse von Protein-Massenspektren Quantitative Analyse von Protein-Massenspektren
Haver05 Prof. Tom O’Haver, Introduction to Signal Processing: Signals and noise, http://www.wam.umd.edu/~toh/spectrum/SignalsAndNoise.html, (Sep. 2005) IUPAC IUPAC Compendium of Chemical Terminology, 2nd Edition, 1997, http://www.iupac.org/goldbook/M03902.pdf (Sep. 2005) Jefferis05 Royston Jefferis, Biotechnol. Prog. 2005, 21, 11-16 KinLev McKinley, S. and Levine, M., Cubic Spline Interpolation, http://online.redwoods.cc.ca.us/instruct/darnold/laproj/Fall98/SkyMeg /Proj.PDF (Sep. 2005) Klein91 Immunologie, Jan Klein, 1. Aufl., Weinheim / New York / Basel / Cambridge, VCH, 1991 Lehmann96 Massenspektrometrie in der Biochemie, Wolf D. Lehmann, Heidelberg / Berlin / Oxford, Spektrum Akademischer Verlag, 1996 Lourakis05 Manolis Lourakis, Levenberq-Marquardt non-linear least squares algorithms in C/C++, http://www.ics.forth.gr/~lourakis/levmar/ (Sep. 2005) Madsen04 K. Madsen, H.B. Nielsen, O. Tingleff, Technical University of Denmark, Lecture Notes, April 2004, http://www.imm.dtu.dk/courses/02611/nllsq.pdf (Sep. 2005) Motulsky Harvey Motulsky and Arthur Christopoulos, Fitting Models to Data Using Linear and Nonlinear Regression, http://www.curvefit.com/manuals/Prism4/RegressionBook.pdf (Sep. 2005) �R Numerical Recipes in C, 2nd edition, William H. Press, Saul A. Teukolsky, William T. Vetterling, Brian P. Flannery, Cambridge University Press, 2002 Raju03 Glycosylation Variations with Expression Systems, T. Shantha Raju, BioProcess International, April 2003 102
Reinhold92 Bruce B. Reinhold and Vernon N. Reinhold, J. Am. Soc. Mass Spectrom. 1992, 3, 207-215 Rockwood95 Alan L. Rockwood, Steven L. Van Orden, and Richard D. Smith, Anal. Chem. 1995, 67, 2699-2704 Šamalikova03 Maria Šamalikova and Rita Grandori, Journal of Mass Spectrometry, 2003, 38, 941-947 SavGol64 Abraham Savitzky and Marcel J. E. Golay, Anal. Chem. Vol 36 No. 8 July 1964, pp. 1627 Schmieder97 Peter Schmieder et al., J. of Magnetic Resonance 1997, 125, 332-339 Senko95 M. W. Senko et al, J. Am. Soc. Mass Spectrom. 1995, 6, 229-233 Stern Brustkrebs – Eine neue Ära, Stern, 02.06.2005 Stryer02 Jeremy M. Berg, John L. Tymoczko, Lubert Stryer, Biochemistry, Fifth Edition, W. H. Freeman and Company New York, 2002 TopHat Serra Jean, Courses on Mathematical Morphology, http://cmm.ensmp.fr/~serra/cours/index.htm (Sep. 2005) Voet&Voet92 Daniel Voet, Judith G. Voet, Biochemie, VCH Verlagsgesellschaft mbH, Weinheim, 1992 Yergey83 James A. Yergey, Int. J. Mass Spectrometry and Ion Physics, 1983, 52, 337-349 103
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Haver05 Prof. Tom O’Haver, Introduction to Signal Processing: Signals and<br />
noise,<br />
http://www.wam.umd.edu/~toh/spectrum/SignalsAndNoise.html,<br />
(Sep. 2005)<br />
IUPAC IUPAC Compendium of Chemical Terminology, 2nd Edition, 1997,<br />
http://www.iupac.org/goldbook/M03902.pdf (Sep. 2005)<br />
Jefferis05 Royston Jefferis, Biotechnol. Prog. 2005, 21, 11-16<br />
KinLev McKinley, S. and Levine, M., Cubic Spline Interpolation,<br />
http://online.redwoods.cc.ca.us/instruct/darnold/laproj/Fall98/SkyMeg<br />
/Proj.PDF (Sep. 2005)<br />
Klein91 Immunologie, Jan Klein, 1. Aufl., Weinheim / New York / Basel /<br />
Cambridge, VCH, 1991<br />
Lehmann96 Massenspektrometrie in der Biochemie, Wolf D. Lehmann, Heidelberg<br />
/ Berlin / Oxford, Spektrum Akademischer Verlag, 1996<br />
Lourakis05 Manolis Lourakis, Levenberq-Marquardt non-linear least squares algorithms<br />
in C/C++,<br />
http://www.ics.forth.gr/~lourakis/levmar/ (Sep. 2005)<br />
Madsen04 K. Madsen, H.B. Nielsen, O. Tingleff, Technical University of Denmark,<br />
Lecture Notes, April 2004,<br />
http://www.imm.dtu.dk/courses/02611/nllsq.pdf (Sep. 2005)<br />
Motulsky Harvey Motulsky and Arthur Christopoulos, Fitting Models to Data<br />
Using Linear and Nonlinear Regression,<br />
http://www.curvefit.com/manuals/Prism4/RegressionBook.pdf<br />
(Sep. 2005)<br />
�R Numerical Recipes in C, 2nd edition, William H. Press, Saul A. Teukolsky,<br />
William T. Vetterling, Brian P. Flannery, Cambridge University<br />
Press, 2002<br />
Raju03 Glycosylation Variations with Expression Systems, T. Shantha Raju,<br />
BioProcess International, April 2003<br />
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