Unser Haushund: Eine Spitzmaus im Wolfspelz? - Wolf-Ekkehard ...

158● Tourette-Syndrome 283 : Fernandez et al. (2012): Rare copy number variantsin tourette syndrome disrupt genes in histaminergic pathways and overlapwith autism. 284"While there was no significant increase in the number of de novo or transmitted rare CNVs in casesversus controls, pathway analysis using multiple algorithms showed enrichment of genes withinhistamine receptor (subtypes 1 and 2) signaling pathways (p = 5.8 × 10(-4) - 1.6 × 10(-2)), as well asaxon guidance, cell adhesion, nervous system development, and synaptic structure and functionprocesses. Genes mapping within rare CNVs in TS showed significant overlap with those previouslyidentified in autism spectrum disorders but not intellectual disability or schizophrenia. Three large, likelypathogenic, de novo events were identified, including one disrupting multiple gamma-aminobutyric acidreceptor genes."Wenn wir jetzt näher auf das oben erwähnte Paper von Nicholas et al. (2011: A highresolutionintegrated map of copy number polymorphisms within and between breeds ofthe modern domesticated dog) zu sprechen kommen, möchten wir die soebenaufgeführten Tatsachen und Überlegungen zu den CNV, speziell zu denGenduplikationen, im Sinn behalten (nicht zuletzt auch die Daten unterhttp://www.weloennig.de/Genduplikationen.html). Einführend lasen wir zu Nicholas etal. den Kommentar eines geachteten Evolutionstheoretikers wie folgt:""In total, we identified 403 CNVs that overlap 401 genes, which are enriched for defense/immunity,oxidoreductase, protease, receptor, signaling molecule and transporter genes."Im Ganzen gesehen scheinen im Vergleich Hund-Wolf bei den Änderungen in der Anzahl derGenkopien Steigerungen und Verringerungen sich die Waage zu halten. Von 101 Genen haben 46 eineSteigerung der Genanzahl erfahren und 55 eine Verringerung."1. Es geht hier nicht um völlig neue funktionale DNA-Sequenzen (neue Gene),sondern ausschließlich um Verdopplungen/Steigerungen bzw. Verringerungen derAnzahl der schon vorhandenen Genkopien bezogen auf ein Referenzgenom (siehe unten).Ausnahmslos alle für die CNVs grundlegenden Gene/funktionalen DNA-Sequenzensind beim Wolf schon vorhanden. Umgekehrt sind jedoch nicht alle funktionalenDNA-Sequences (Gene) von Canis lupus lupus auch beim Hund vorhanden (siehe obenzum Beispiel die Genfunktionsverluste bei Nackthunden, die Serie der rezessivenDefektmutationen zum coat colour oder deficiency in either growth hormone or IGF1:diminished stature und weitere Gene aus der Datenbank http://omia.angis.org.au/home/.2. Man kann also sehr wohl behaupten, dass das das Genom des Haushundesbezogen auf die funktionalen DNA-Sequenzen nur eine Teilmenge des Wolfsgenomsist – da bei den verschiedenen Hunderassen jeweils unterschiedliche Genfunktionen283 "Das Gilles-de-la-Tourette-Syndrom (kurz: Tourette-Syndrom) ist eine neurologisch-psychiatrische, ätiologisch noch nicht abschließend geklärte Erkrankung, diedurch das Auftreten von Tics charakterisiert ist. Es wird zu den extrapyramidalen Hyperkinesien gerechnet. Bei den Tics handelt es sich um unwillkürliche, rasche,meistens plötzlich einschießende und mitunter sehr heftige Bewegungen, die immer wieder in gleicher Weise einzeln oder serienartig auftreten können. Verbale,ungewollte Äußerungen zählen mit dazu sowie Ausrufe oder eigenartige Geräusche." http://de.wikipedia.org/wiki/Tourette-Syndrom (Zugriff am 14. 11. 2012)284 Fernandez TV, Sanders SJ, Yurkiewicz IR, Ercan-Sencicek AG, Kim YS, Fishman DO, Raubeson MJ, Song Y, Yasuno K, Ho WS, BilguvarK, Glessner J, Chu SH, Leckman JF, King RA, Gilbert DL, Heiman GA, Tischfield JA, Hoekstra PJ, Devlin B, Hakonarson H, Mane SM, GünelM, State MW. (2012) http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22169095Zu exon number variants vgl. z. B. http://www.plosgenetics.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pgen.1000536 (2009) (Es geht umexonic deletions, exonic duplications "and whole gene duplications”: "Although some published analyses emphasize the greater contribution ofgene deletion events in autism pathogenesis [7], there are also clear examples of duplications that strongly modulate ASD risk [43],[44]. Wetherefore conducted a parallel analysis of duplications, distinguishing between events involving entire genes (gDups) which might increasedosage and those restricted to internal exons (eDups) which could give rise to a frameshift or map to a chromosomal region distinct from thereference gene. For gDups, we identified 449 genes that were duplicated in at least one AGRE case but no CHOP/NINDS controls (Table S4). Ofthose, 200 genes at an estimated 63 loci, including genes at 15q11.2 [43], met the more stringent criteria of being present in three or more casesfrom at least two independent families (Table S5). Of these, 11.5% (23/200) were also seen in ACC controls, whereas 24.5% (49/200) were casespecificin the replication cohort. Strong statistical support was obtained for established loci (e.g. p = 9.3×10−6 for UBE3A and other genes in thePWS/AS region at 15q11–q13), and nominal evidence was observed for the following novel loci: CD8A at 2p11.2 (p = 0.069), LOC285498 at4p16.3 (p = 0.028), and CARD9/LOC728489 at 9q34.3 (p = 0.005).”