Angelika Semmler - KOPS - Universität Konstanz
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5 Anwendung der Methode<br />
und Affinität. Bei gleicher Peptidsequenz bindet das lineare Peptid 1000fach<br />
schlechter als die durch Cyclisierung strukturell eingeschränkten Gegenspieler.<br />
Peptidsequenz<br />
Tabelle 5 Literaturwerte von Streptavidin-„HPQ-Peptid“-Bindungskonstanten. *:für<br />
Werte, die mittels SPR bestimmt wurden, wird zwischen steady-state-affinity<br />
(ssa) und kinetischer (kin) Auswertung unterschieden. ND: aufgrund zu<br />
geringer Affinität konnten keine Bindungskonstanten bestimmt werden.<br />
K D (µM)<br />
*ssa./kin.<br />
Methode Lit<br />
AECHPQGPPCIEGRK --/0,23 SPR (Pept. Immob.) [118]<br />
AESHPQGPPSIEGRK ND SPR (Pept. Immob.) [118]<br />
AEC(Acm)HPQRPPC(Acm)IEGRK ND SPR (Pept. Immob.) [118]<br />
AECHPQFSNCIEGRK ND SPR (Pept. Immob.) [118]<br />
AECHPQFPCIEGRK ND SPR (Pept. Immob.) [118]<br />
AECHPQFSNCIEGRK ND SPR (Pept. Immob.) [118]<br />
AECHPQFNCIEGRK ND SPR (Pept. Immob.) [118]<br />
AECHPQFCIEGRK --/0,66 SPR (Pept. Immob.) [118]<br />
FSHPQNT 125,0 ITC [117]<br />
HDHPQNL 282,0 ITC [117]<br />
Ac-AHPQFPAEK-CONH 2 357,0/ -- SPR (SA Immob.) [119]<br />
Cyclo[AHPQFPAE]K-NH 2 0,270/0,257 SPR (SA Immob.) [119]<br />
Cyclo[AHPQFPAE(K-NH 2)] 0,435/0,355 SPR (SA Immob.) [119]<br />
H 2 N-AWRHPQFGG-OH (pStrep tag) 36,79 ITC [115]<br />
F V -Strep-Tag (exprim.Protein+tag) 18,38 ITC [115]<br />
Ac-WSHPQFEK-OH (pStrepTagII) 72,0 ITC<br />
H2N-CWHPQAGC-OH 13,0 ITC<br />
Es bleibt aber zu erwähnen, dass in der Literatur auch mehrfach Hitsequenzen<br />
gefunden wurden, deren Bindung zu Streptavidin so schwach war, dass die<br />
dazugehörigen KD-Werte nicht bestimmt werden konnten. [90, 118] Meist wurden<br />
ersatzweise IC50-Werte bestimmt.<br />
74<br />
[115]<br />
[115]