Angelika Semmler - KOPS - Universität Konstanz
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4 Analytik<br />
machen [91-94] . Mit dem biphasic approach nimmt man jedoch einen entscheidenden<br />
Nachteil auf sich. Man gibt das OBOC-Prinzip auf. Dies ist jedoch nicht sinnvoll; denn<br />
gerade von cyclischen Peptiden erhofft man sich nicht nur eine sequenzspezifische<br />
Selektivität, sondern vor allem auch eine konformative Selektivität. Das heißt durch<br />
ihre konformative Einschränkung passt das Peptid ideal in die Bindungstasche des<br />
Targets, oder aber es passt nicht. Bei der Anwendung des biphasic approachs liegt<br />
die konformative Einschränkung jedoch nur auf der Außenschale der Kugel vor.<br />
Gelingt es dem biologischen Target wider Erwarten ins Innere der Kugel<br />
einzudringen, so handelt es sich nur noch um sequenzspezifische Selektivität (dies<br />
bedeutet falsch positive Antworten). Außerdem kann durch das Aufteilen der Kugel<br />
die Vollständigkeit der Cyclisierung nicht mehr überprüft werden. Die Cyclisierungs<br />
reaktion stellt jedoch oft eine wesentliche Herausforderung während der Synthese<br />
dar. [95] In unseren Augen ist der Verlust des OBOC-Prinzip eine zu große<br />
Einschränkung, weshalb wir uns gegen diesen Kompromiss entschieden haben.<br />
4.2.3 Erweiterung des PEDs auf OBOC-Cyclopeptidbibliotheken<br />
Um auch cyclischen Peptiden einen Zugang zum PED-MS zu geben, haben wir uns<br />
für eine Seitenketten-Cyclisierung entschieden. Die Idee dabei ist, dass somit der<br />
N-Terminus des Peptids für den Edman-Abbau frei zugänglich bleibt, der Ring<br />
sozusagen über eine Sollbruchstelle verfügt (Abschnitt 3.5 und Abb. 4.8). Unterzieht<br />
man solche seitenkettencyclisierte Peptide einem partiellen Edman-Abbau, so erfolgt<br />
im ersten Abbau-Zyklus die Ringöffnung. Man erhält ein lineares Peptid, welches das<br />
N-terminal gespaltene Phenylthiohydantoin-Derivat über die Seitenketten-<br />
verbrückung gebunden mit sich trägt. Das lineare Peptid kann den Abbauzyklus<br />
erneut durchlaufen, so lange bis alle variabel besetzten Positionen bestimmt wurden.<br />
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