Angelika Semmler - KOPS - Universität Konstanz

1 Einleitung
welches LC-MS/MS-Spektren automatisiert aus- bzw. bewertet. Das Programm ist
speziell auf cyclische Peptide aus OBOC-Bibliotheken zugeschnitten und
berücksichtigt durch die Split-Mix-Synthese vorhandene Sequenzinformationen, wie
eingesetzte Aminosäuren, sowie die Anzahl und Häufigkeit der Aufspaltungen. Zur
Auswertung können jedoch keine Peaklisten, sondern lediglich die erhaltenen
Rohdaten von Hitachi 3DQ-ion trap Massenspektrometern herangezogen werden. [29]
a
E
A b
D C
B
a
b
A B C D E
B C D E A
C D E A B
D E A B C
E A B C D
Abb. 1.4 Die Isolierung und anschließende Fragmentierung eines cyclischen Peptids im
Massenspektrometer führt zu einer Reihe von Fragmentionen mit identischer
molekularen Masse aber unterschiedlicher Aminosäurensequenz.
Soll zur Sequenzierung eines cyclischen Peptids eine auf Edman-Chemie
basierende Sequenzierungsmethode (Microsequenzierung oder Leitersequen-
zierung) zum Einsatz kommen, ist das Vorhandensein des freien N-Terminus
unbedingt notwendig.
Eine präanalytische, also unmittelbar vor der Sequenzierung stattfindende,
Umwandlung der cyclischen Peptide in lineare Peptide würde einen deutlich
besseren Zugang zur Sequenzinformation mittels massenspektrometrischer und
Edman-basierter Methoden ermöglichen.
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