pdf-Dateien - Nationales Genomforschungsnetz - NGFN

Forschung 10tiert werden können.3. Dieselben von den cDNAs kodierten Proteinewerden auch mit Proteomics-Ansätzen bearbeitet.So werden systematisch Protein-ProteinInteraktionen mit dem Hefe-Zwei-Hybrid-Systemuntersucht, die Proteine werden rekombinantexprimiert, gereinigt und auf Protein-Arrays analysiert.Die für die einzelnen Proteine ermittelten Datenwerden über die Datenbank www.dkfz.de/LIFEdbder Öffentlichkeit zugänglich gemacht undständig erweitert (Bannasch et al., 2004).Innerhalb des NGFN ist das Deutsche cDNANetzwerk in ein Konsortium von mehreren SystematischMethodologischen Plattformen(SMP) eingebunden. Diese Plattformen generierenzusätzlich zu den funktionellen Datenaus zellbiologischen Ansätzen weitere Informationenzu den Genen, Transkripten und Proteinen,hin zu Maus-Modellen, wodurch sichdurch Daten-Integration letztlich ein umfassendesBild (Abb. 1) für diese Moleküle und derenEinfluss in funktionelle und regulatorische Wegeund deren Veränderungen in gesunden undkranken Zuständen ergibt. Dieses Konzept istbereits jetzt für Kooperationen offen, in denenwir die funktionelle Plattform verfügbar machen.Parallel wird das Portfolio der durchgeführtenAssays und Analysen auch in Kooperationenständig erweitert, um eine möglichstgroße Zahl der sehr diversen Proteine funktionellcharakterisieren zu können.Literatur• Bannasch, D. et al. (2004). LIFEdb: A database forfunctional genomics experiments integrating informationfrom external sources, and serving as asample tracking system. Nucleic Acids Res. DatabaseIssue, in press• Imanishi, T. et al. (2003). Integrative Annotation of23,149 Human Genes Validated by Full-Length cDNAClones. Submitted to Nature.• Simpson, J. C. et al. (2000). Systematic subcellularlocalization of novel proteins identified by largescale cDNA sequencing. EMBO Rep 1, 287-292.• Wiemann, S. et al. (2003). The German cDNA Network:cDNAs, functional genomics and proteomics.Journal of Structural and Functional Genomics,in press. (http://www.kluweronline.com/issn/1345-711X/contents - forthcoming papers.)• Wiemann, S. et al. (2001). Toward a Catalog ofHuman Genes and Proteins: Sequencing and Analysisof 500 Novel Complete Protein Coding HumancDNAs. Genome Res 11, 422-435.Kontakt:Stefan WiemannDKFZ, Abt. Molekulare GenomanalyseIm Neuenheimer Feld 580 · 69120 HeidelbergE-mail: s.wiemann@dkfz-heidelberg.deHumangenomforscher werfen ihre Netze ausPartnering Days für NGFN 2 am 25./26. August 2003 in BonnChristina Schröder, Verein zur Förderung der Humangenomforschung e.V.,Florian Becke, Technologietransferstelle im NGFN„Scientists want to cast nets, not to be caughtin them“ charakterisierte Nikolaus Zacherl mitden Worten von Gottfried Schatz sehr treffenddie Erwartungshaltung der Teilnehmer zu Beginnder Partnering Days im Bonner Hotel Maritim,also in der Nachbarschaft des Bundesministeriumsfür Bildung und Forschung (BMBF).Die Veranstaltung war vom BMBF und dem Projektmanagementdes Nationalen Genomforschungsnetzes(NGFN) für den 25. und 26.August 2003 organisiert worden und bildet denAuftakt für die weitere staatliche Förderung derdeutschen Humangenomforschung ab 2004.Grundlage für die Partnering Days und das weitereVerfahren ist das Konzept zum NGFN 2,welches im Frühjahr 2003 erarbeitet undAnfang August veröffentlicht wurde (sieheauch GenomXPress 2/03, Seiten 12-13). DiePartnering Days wurden den Humangenomforschernaus akademischen Forschungseinrichtungen,Kliniken und Industrie als Informations-und Kontaktbörse angeboten. Sie solltebereits im Vorfeld der Bekanntmachung zurKoordinierung der Antragstellung für dasBMBF-Förderprogramm NGFN 2 beitragen.Über 400 Teilnehmer waren der Einladung gefolgt.Peter Lange, Unterabteilungsleiter Gesundheitund Biowissenschaften im BMBF, kündigte beider Eröffnung der Partnering Days an, dass dieNikolaus Zacherl, Forschungsinstitut für MolekularePathologie GmbH, Wien und Vorsitzender des Vereinszur Förderung der Humangenomforschung e.V.Peter Buckel, Xantos Biomedicine, und Thomas Ried,National Cancer Institute, USA moderierten dieProjektvorschläge aus dem Indikationsbereich KrebsGroßes Interesse: Plenarsitzung währendder Partnering Days NGFN 2GenomXPress 3/03