Öffnen - eDiss - Georg-August-Universität Göttingen

Öffnen - eDiss - Georg-August-Universität Göttingen Öffnen - eDiss - Georg-August-Universität Göttingen

ediss.uni.goettingen.de
von ediss.uni.goettingen.de Mehr von diesem Publisher
06.04.2014 Aufrufe

Ergebnisse – Kapitel 4.6. Die AMOVA mit 10.000 Permutationen ergibt folgende Distanzmatrix (Tab. 4.25): Tabelle 4.25: Distanzmatrix der AMOVA-Berechnung. Im Rechteck unterhalb der Diagonalen ist der R ST -Wert dargestellt, oberhalb der zugehörige p-Wert. In Fett/kursiv unterlegt sind nicht signifikante Unterschiede zur Kasseler Serie. Population Berlin Biella Blek. Gran. Brab. Smol. Strasb. Toul. Västerb. War. Mass. Berlin - 0.0011 0.0135 0.0000 0.0000 0.0052 0.0019 0.0042 0.0021 0.0000 0.0000 Biella 0.0426 - 0.0120 0.3383 0.1462 0.0000 0.7012 0.9049 0.0077 0.0000 0.0761 Blekinge 0.0359 0.0445 - 0.0009 0.0001 0.0000 0.0065 0.0058 0.2139 0.0000 0.0000 Granada 0.0433 0.0003 0.0666 - 0.0455 0.0000 0.9493 0.7682 0.0019 0.0000 0.1996 Brabant 0.0619 0.0064 0.1046 0.0105 - 0.0000 0.2551 0.3536 0.0000 0.0000 0.2467 Smolensk 0.0455 0.1489 0.1451 0.1260 0.1816 - 0.0000 0.0000 0.0001 0.2045 0.0000 Strasbourg 0.0378 -0.0057 0.0557 -0.0068 0.0024 0.1242 - 0.9774 0.0076 0.0000 0.7045 Toulouse 0.0365 -0.0092 0.0579 -0.0055 0.0001 0.1350 -0.0110 - 0.0060 0.0000 0.3466 Västerbotten 0.0531 0.0512 0.0092 0.0617 0.1060 0.1202 0.0521 0.0606 - 0.0000 0.0000 Warsaw 0.0494 0.1650 0.1505 0.1475 0.1731 0.0049 0.1484 0.1484 0.1595 - 0.0000 Massengrab 0.0553 0.0114 0.1053 0.0031 0.0022 0.1553 -0.0049 0.0006 0.1009 0.1551 - Die geringste Distanz wurde zur Population aus Strasbourg ermittelt. Weitere nicht signifikante Unterschiede gab es zu den Populationen aus Toulouse, Brabant, Granada und Biella Piedmont. Im NJ-Baum wird die Kasseler Serie zusammen mit Brabant und Strasbourg geclustert (Abb. 4.28). Massengrab KS Abbildung 4.28: Phylogenetischer Baum berechnet nach NJ- Methode. Kassel clustert mit den Populationen aus Brabant und Strasbourg. 100

Ergebnisse – Kapitel 4.6. Aufbauend auf diesen Ergebnissen wurden in einer zweiten AMOVA nur Populationen aus Mitteleuropa miteinander verglichen. In dieser Analyse wurden Populationen aus Deutschland (Köln, Stuttgart), Frankreich (Lille, Marseille, Toulouse, Strasbourg), Benelux (Noord-Brabant, Walloon), der Schweiz (Zürich) und Italien (Trino Piedmont) mit der Kasseler Serie verglichen (Abb. 4.29). Abbildung 4.29: Übersicht der Populationen in der zweiten AMOVA-Analyse über Europa. (Karte von wikipedia, bearbeitet) Die AMOVA mit 10.000 Permutationen ergibt folgende Distanzmatrix (Tab. 4.26): Tabelle 4.26: Distanzmatrix der zweiten AMOVA-Berechnung. Im Rechteck unterhalb der Diagonalen ist der R ST -Wert dargestellt, oberhalb der zugehörige p-Wert. In Fett/kursiv unterlegt sind nicht signifikante Unterschiede zur Kasseler Serie. Population Col. Lille Mars. Brab. Strasb. Stutt. Switz. Toul. Trino Wall. Mass. Cologne - 0.6275 0.1319 0.0093 0.2136 0.2890 0.1669 0.3506 0.0008 0.4192 0.0126 Lille -0.0026 - 0.6868 0.3595 0.9410 0.4232 0.6101 0.8780 0.0363 0.8413 0.4479 Marseille 0.0082 -0.0076 - 0.2156 0.8602 0.2038 0.3838 0.8312 0.2363 0.5418 0.1829 Brabant 0.0127 0.0002 0.0051 - 0.2559 0.0047 0.1550 0.3543 0.0053 0.4919 0.2449 Strasbourg 0.0027 -0.0097 -0.0110 0.0024 - 0.1468 0.3516 0.9762 0.1025 0.8033 0.7039 Stuttgart 0.0003 -0.0006 0.0048 0.0160 0.0044 - 0.2771 0.3854 0.0051 0.3026 0.0031 Switzerland 0.0022 -0.0035 -0.0007 0.0042 0.0004 0.0008 - 0.6458 0.0181 0.4914 0.0321 Toulouse 0.0005 -0.0091 -0.0108 0.0001 -0.0110 -0.0002 -0.0041 - 0.1169 0.9219 0.3339 Trino 0.0470 0.0316 0.0056 0.0576 0.0182 0.0353 0.0320 0.0157 - 0.1108 0.0056 Walloon -0.0009 -0.0109 -0.0063 -0.0032 -0.0103 0.0016 -0.0031 -0.0136 0.0212 - 0.6338 Massengrab 0.0134 -0.0012 0.0068 0.0022 -0.0049 0.0202 0.0137 0.0006 0.0510 -0.0056 - 101

Ergebnisse – Kapitel 4.6.<br />

Die AMOVA mit 10.000 Permutationen ergibt folgende Distanzmatrix (Tab. 4.25):<br />

Tabelle 4.25: Distanzmatrix der AMOVA-Berechnung. Im Rechteck unterhalb der Diagonalen ist der<br />

R ST -Wert dargestellt, oberhalb der zugehörige p-Wert. In Fett/kursiv unterlegt sind nicht signifikante<br />

Unterschiede zur Kasseler Serie.<br />

Population Berlin Biella Blek. Gran. Brab. Smol. Strasb. Toul. Västerb. War. Mass.<br />

Berlin - 0.0011 0.0135 0.0000 0.0000 0.0052 0.0019 0.0042 0.0021 0.0000 0.0000<br />

Biella 0.0426 - 0.0120 0.3383 0.1462 0.0000 0.7012 0.9049 0.0077 0.0000 0.0761<br />

Blekinge 0.0359 0.0445 - 0.0009 0.0001 0.0000 0.0065 0.0058 0.2139 0.0000 0.0000<br />

Granada 0.0433 0.0003 0.0666 - 0.0455 0.0000 0.9493 0.7682 0.0019 0.0000 0.1996<br />

Brabant 0.0619 0.0064 0.1046 0.0105 - 0.0000 0.2551 0.3536 0.0000 0.0000 0.2467<br />

Smolensk 0.0455 0.1489 0.1451 0.1260 0.1816 - 0.0000 0.0000 0.0001 0.2045 0.0000<br />

Strasbourg 0.0378 -0.0057 0.0557 -0.0068 0.0024 0.1242 - 0.9774 0.0076 0.0000 0.7045<br />

Toulouse 0.0365 -0.0092 0.0579 -0.0055 0.0001 0.1350 -0.0110 - 0.0060 0.0000 0.3466<br />

Västerbotten 0.0531 0.0512 0.0092 0.0617 0.1060 0.1202 0.0521 0.0606 - 0.0000 0.0000<br />

Warsaw 0.0494 0.1650 0.1505 0.1475 0.1731 0.0049 0.1484 0.1484 0.1595 - 0.0000<br />

Massengrab 0.0553 0.0114 0.1053 0.0031 0.0022 0.1553 -0.0049 0.0006 0.1009 0.1551 -<br />

Die geringste Distanz wurde zur Population aus Strasbourg ermittelt. Weitere nicht<br />

signifikante Unterschiede gab es zu den Populationen aus Toulouse, Brabant, Granada<br />

und Biella Piedmont. Im NJ-Baum wird die Kasseler Serie zusammen mit Brabant<br />

und Strasbourg geclustert (Abb. 4.28).<br />

Massengrab KS<br />

Abbildung 4.28: Phylogenetischer Baum berechnet nach NJ-<br />

Methode. Kassel clustert mit den Populationen aus Brabant und<br />

Strasbourg.<br />

100

Hurra! Ihre Datei wurde hochgeladen und ist bereit für die Veröffentlichung.

Erfolgreich gespeichert!

Leider ist etwas schief gelaufen!