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Identifizierung und Charakterisierung von neuen Genen für die ...

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Y112<br />

Y100<br />

Y32<br />

Y25<br />

Y86<br />

Y119<br />

Y137<br />

brain<br />

adult 3 1<br />

brain<br />

adult 3 1<br />

brain<br />

adult 2 1<br />

brain<br />

adult 2 1<br />

brain<br />

adult 4 1<br />

brain<br />

adult 3 1<br />

brain<br />

adult 1 1<br />

RACK1<br />

receptor for<br />

activated<br />

protein<br />

kinase mCG19409<br />

mediator<br />

RNA pol II<br />

(NCBI),<br />

Eg1<br />

enothelial<br />

derived<br />

gene<br />

(Celera) mCG21482<br />

- 80 -<br />

AATGGGATTTGGGWTCYATGGAATAATTWTGTTTCTGGGAAAAAWGCTTAATTGGCARAGGYCATTCCTTCCTGTTTGGCATATCTTC<br />

CATAATTGAAAMCGAAAACATYYAAAWTCYTTTAAAAAARTCTYYYCCYTGC<br />

AAAAWMCSGCACRAGCCCATTGGCCCACTGGCTCCTGAACACAGTGACTGTCTCTCCAGATGGATCCCTCTGTGCTTCTGGAGGCA<br />

AGGATGGCCAGGCTATGCTGTGGGATCTCAATGAAGGCAARSACCTCTACACTTTAGATGGTGGGGACATCATCAATGCCTTGTGCT<br />

TCAGCCCCAACCGCTACTGGCTCTGCGCTGCCACTGGCCCCAGCATCAAGATCTGGGACTTGGAGGGCAAGATCATTGTAGATGAAT<br />

TGAAGCAAGAAGTTATCAGCACCAGCAGCAAGGCAGAGCCACCCCAGTGTACCTCTTTGGCATGGTCTGCTGATGGCCAGACTCTGT<br />

TTGCTGGCTATACAGACAACTTGGTGCGAGTATGGCAGGTAACTATTGGTACCCGCTAAAAGTTTTATGACAAAGTCTTARAAATAAAC<br />

TGGCTTTCTGAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTCRAGAAGCTTTGGACTTCTTCGCCAGAGGTTTGGTCAAGTCTCCAATCAAGGTTGTCG<br />

GCTTGTCTACCTTGCCAGAAATTTACRAAAAGATGGAAAAGGGTCAAATCGTTGGTAGATACGTTGTTGACACTTCTAAATAAGCRAAT<br />

TTCTTATGATTTATGATTTTTATTATTAAATAAGTTATAAAAAAATAAGTGTATACAAATTTAAAGTGACTCTTAGGGTTTTAAAMCRAAAA<br />

TTCTTATTCTTGAKTACTCTTTCCTGARGGTCARGGTGSTTTCTCAGGTTTGGCATGGAGGTCSCTCTTATTGACACCCTYTTCCSGGC<br />

ATGCCGRGCAAATGCCCKGMAWYSSTCCCATTTCMCCCA<br />

GACMATTTWRGATGTGCCGATTATGCCTCTCCCGAATTCGGCACGAGSKGRKGYWCRCYGGGMWGMCTSMARGTCCTSCSCCGCC<br />

GCCGCCCGGGCTCCCGGCGAGGCKKCSCTTCTGCAARCRGCCCMTGKGGCCCCGAGRCCATATAACAKCACTTTGGTGGACGAGT<br />

TGGAGTCATCCTTCGAGGCTTGCTTTGCTTCCCTTGTGAGTCAKGATTATGTCMWTGGGACTGATCAGGAAGAAATTCTCACTGGTGT<br />

TGATCKSTGTATCCAGAAGTTTTTGGAAARGGSAAGACARACAGAATGTTTTTTCCTACMMAAAAKGTTTCMAKARTCTTTCCWSAWA<br />

CCMRATCARKWTATSAAASACGATGMCTCSSAACTAAAGAGTGAACTGCWRCGGARAGATGCGCTAGTCCACAWGCAGTTGACCTA<br />

RCTGAGGCATTGGCWRCRCGWGCTGGAGGACMTTACTTTTCAKSACARGAAGCCGGCTGACWTGCMTYATGSATCRTTGACCTTCC<br />

TCKMGCWGGSGTSTGCSACCATTCKTTCAMCTCGGAMGTGGWCCTAAKCMCTCTTGCTCTGKCTTGMAKCCTTGCMRYCTCGTGK<br />

WACACGTRTCCTTACYKCCCTGRTGTGWWKGAAAGMCTGTGTKAGATAATGGAKTGGTMTCAGMYTYTRTCCCTAMTAMAASGTTG<br />

GGKTCTATAATKGACCCSGTGAKGGGACWTGAATCTTYGATCCCGTGSSKCCCCTTCTGTAGTCTAAGGACSYCTWKAAASTTTATAA<br />

TAAACKTCYGWCTCTKWTAAATAATAYAATATAAAACAACCAGRGAGGGKTTGRRYCTCTTMWCAYAGMRARAARAACACCMARGAG<br />

GTGGCSTTTAAACTCAYT<br />

periphilin<br />

similar<br />

Riken<br />

cDNA<br />

spectrin<br />

mCG51743<br />

related mCG7105 acacagtgtcctggagaaaggcttcttgaaagaaaaggaacaggttgc<br />

prefoldin<br />

subunit 5 mCG8908<br />

Kif2a<br />

kinesin<br />

family<br />

member<br />

2A mCG9794<br />

Usp33<br />

ubiquitin<br />

specific<br />

protease<br />

33 mCG21832<br />

ATKYTTTTCTCCSGAAWWCGGCACGAGAGCAGTTTCTTCATCCAAGATGTTAGACAAAACCATCAAGCTMACTGAGAAGGAACTTGC<br />

TGAGGCTGAAAGCAAGTGGGCTAACGAAACACTAGAGCAGTCCAACAAAAATCACTTGACTGAAATTTCTAAGTTTCAGGTGAGATCC<br />

ATGGCACCCCTAGTTATTGATCAGACAGAAGGACCCAAGTCAAATACAGAAAATGCCATAGCAATGAATGAAGACAGCCAACTTASCA<br />

GCCGCACTAAAGCCATCATATCGAAGACCAAACAGATCGAGGAGGTTTACCTACAATATTGTGAGACTTTTGCAATAGTGGWGAAAAT<br />

GCTGCTTGACAAAGACCCCTCATTACAAAAGTCTATCCAGTTTGCACTGAGACAAAATTTACAGGAAATGAGTGAGCGCTGTGTTGAA<br />

GAACTCAACTGTTTCATTACTGAGTATGATAATTCTCAAGATTTCGGAGACCCTTTTAAGAAGTAGTACACAGGTCAAAAAAATTTTTTT<br />

GGTTCTTTTCTCCTTGGATTGTGTAAATCCTTACTATTTTGTGATGAAGAAAAATACTTTGACAGCTGGATGCATTTCCAATAATAAACA<br />

TCTACAATAAAAAAAAAAAAAAAAAMCTCGAGAAGCTTTGGACTTYTTCGCCAGAGGTTTGGTCAAGTCTCCAATCARGGTTGTCGGC<br />

TTGTCTACCYTTGCCAGAAATTTACGAAAAGATGGAAAAGGGTCAAATCGTTGGTAGATACGTTGTGACMCTTCTAATAAGCGAATTTC<br />

TTATGATTATGATTTTTAWTATAAATAGTTATAAAAAAATAGKGKWWCMAATTTAAGKRCTYYTTAGGTTTAAAACSAA<br />

GACYAATTTTAKGRKGWCSCMGATTATGCYTCTCCCGAATTCGGCACGAGCAACATGGCGCAGTCGATTAACATCACGGAGCTGAAT<br />

CTGCCACAACTGGAAATGCTCAAGAACCAGCTGGACCAGGAAGTGGAGTTTTTGTCCACGTCCATTGCTCAGCTCAAGGTGGTCCAG<br />

ACCAAGTACGTGGAAYCCAAGGACTGTCTGAACGTGCWRAACAAGAGCAACGAGGGAAAAGAATTACTGGTCCCACTGACGAGTTC<br />

TATGTACGTCCCCGGGAAGCTACACGATGTGGAGCATGTGCTTATTGATGTGGGAACCGGCTACTACGTGGAGAAGACAGCTGAGG<br />

ACGCCAAGGACTTCTTCAAAAGGAAGATAGACTTCCTCACCAAACAGATGGARAAAATCCAGCCAGCGCTGTAGGAGAAGCATGCCA<br />

TGAAGCAGGCTGTCATGGAAATGATGAGCCAGAAGATTCAGCAGCTCACAGCCCTGGGGGCAGCGCAGGCCACGGTCAAAGCCTGA<br />

GAGTGCACTGCAGAAATGAAGCAGAGTGAGGGACCCTTCTTCAAGGGGCCTGGGACTTTTTCCGGCAATGGCCTCCTGGGAAAGTG<br />

GCCTGGAAGAGAGTGTTTTGTGTTTAATGTTAATAAATGTGACCGCTGCGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCTCGAGG<br />

CTTTGGACTCTTCSCCRAGTTTGTCAGTCTCAYYAGGTTGCGGCTTGYCTACYTGCMRSAATTTAMAAAGRWGGAAAGGYMATYGTT<br />

GGTAAAMCGTTGTKRCCCTTCTAATARSCGATTYTTAWGATTAKRTTTTTWTWWTAAAWAAGTAWAA<br />

CACYATTTRKGRTGYGCCGATTATGCCTCTCCCGAATTCGGCACGAGCTCATATGCTACACAACTTGAAGCTATTCTTGAGCAAAAAA<br />

TAGACATTTTAACTGAGTTACGAGATAAAGTGAAATCTTTTCGCGCAGCGCTACAAGAAGAAGAGCAAGCAAGCAAGCAAATTAACCC<br />

CAAGAGGCCCCGAGCCCTCTAAGTTGGCGTTTGCTACTAAAGGATCCCCAGAATCCCCAATACTGTAACAACGGTGGTCCGACTGTA<br />

AAGGCCAMTTGAACGTTTTTGAAATCTTTTTTTTTTTTTTTTAACGTTTTTTGAAATCTTAAGTGTGTGGAAAATATCTTGTCCTTCATCT<br />

GAATGACATTTCAATTKTGTGAAACACTCCTTTGTCGACAAAATGCTTYTARACCAARAGGCACAACTAATAATTCGGACTAGTGAAGT<br />

WTTTTGTTTCATTTGCCCAAATAAATAGTGATTGCTTTTGGATATCCTTGCCAATTTTATTTAAAGATTGTGGAAGTGATCCAGAAGTGG<br />

AAGATAGGGGAAGCCACAGAATTTCCTTTAACGCAGATCAATTTTCATAGCAAGACTGAGCAATTTTGAACCCTTTGCGTGCATGCATA<br />

CCTCATGAGTGATTGWMCATACTTTGCCTACTCCTAGAGACACTCGTGCTTACTCATCCTTCTGTGCCTTGGCTAAGGCTATTGACCC<br />

TAGATTTCTAAACCRCCCGARATTAATTACATTCCTGGTTTGKGMTKGWAWTWCCTTTACTGKKTGTACATTTTWCCTGWATTWRAG<br />

ACTTTTTTTGTGKGTGACTTRRTTAATTTGSAGRWAGTGCCWTATMATTTGACCGAAMTAAATYTKKGACCAW<br />

GYYTTCTCCCGAAWWCMSGCACGAGGTATGGAGGAGGGCCTGCTGTCAACCATCTCTACATCTGCCACACCTGCCAAATTGAGTTA<br />

GARAAGATTGAAAAACGAAGAAAAACCGAATTGGAAATTTTTATTCGGCTCAACAGAGCATTTCARGAGGAGGACTCCCCAGCTACTT<br />

TTTACTGTATCAGCATGCAGTGGTTTAGAGAATGGGAGAGTTTTGTAAAGGGTAAGGATGGAGATCCCCCAGGTCCAATCGACAACA<br />

CTAAAATTGCGGTTACTAAATGTGGCAGTGTGATGCTCAAGCAAGGAGCAGACTCTGGTCAAATTTCARAARAAACATGGAATTTCCT<br />

GCAGTCTATRKAKGGKGGGGGGCCTGAAGTTATCCTCCGACCTCCAGTTGTTCATGTTGACCCTGATGTACTCCAAGCAGAGGAAAA<br />

GATTGAAGTAGAAACTCGCTCTTTGTAGTTCTGAGGACACAGAGCTCTAATGAGAAGTTATTCTCACTTGATGCACACACATTCAAAAC<br />

ATTCCGCAAAGCATGTTGATTCTCTTGATTTTCATCCTTTTTTCTCATTTATTCCTTTGTACTGGGCATTATGGAAGGGTATAWTAAATG<br />

TTATATAAGTTGGGTATATTTAATGCTASTAACTTACCARAATATCTTTMGTGTACTGKTTTAAAARAAAGGGACARKTGGTAACTTRGG<br />

TTCTYTGACCTTTGTTCTCCAGGCAGATCAGMAACCTTTGKAGCMCTGTAAATMCTTTGGCTTMATAWTGTTCTTATTACTYTAAACCA<br />

TCWWACTGGCTTAGCTTTTTMTTTYTTCCAAAGSCTATTATTGKWTATTTTKGMATG<br />

Die Ab<strong>und</strong>anz in der Tabelle gibt an, wie häufig ein solcher Klon in dem Screen gef<strong>und</strong>en wurde.<br />

Zusammen mit der durchschnittlichen relativen GFP-Leuchtintensität (1 sehr stark bis 4 sehr schwach)<br />

könnte man daraus Vermutungen über <strong>die</strong> Wahrscheinlichkeit oder Stabilität einer Protein-Interaktion<br />

aufstellen.<br />

Die zur Annotation verwendeten Sequenzen sind hier mit angegeben, da <strong>die</strong> Celera-IDs unter Umständen<br />

eines Tages nicht mehr zugänglich sein könnten, um <strong>die</strong> Klone identifizieren zu können.<br />

Mögliche Interpretationen der gef<strong>und</strong>enen Gene im Zusammenhang mit TRIM46 werden im<br />

Diskussionskapitel besprochen.

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