Identifizierung und Charakterisierung von neuen Genen für die ...
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Haupt-Splicevariante 2 (enthält cDNA12 mit 5’- wie 3’- terminalen Ergänzungen):<br />
TGGAGAAAGAGGGGAGCCAAAGCCGGCGCGGTTGTCTGTACGCAGGCGTCGGGGCCAACGTGGACTTGCTTTACTTCTTCCTCTACGCGCCTTGGGT<br />
GCAGCGCCCTCTTGTGGCAAGGAGGAAATAATGCTTCTAAGAGCATTCTAGGCCACCGCCCTGCTTGGTCTCCAGCCTTCTGTAGCCAAGGCATCTG<br />
CTGTCTCTCTGGACAAGCTGCACTCATCTTTCAGTCATGATCCCATGGCCTAGAGTCACCTGTGCCTTCATTGCTATTCATGTCATCTCCCGTACAA<br />
CTTCCTCAGACCTCCCTGACCCACTATAATTGCCTCAACAACTCCCGAAGATATGTGCCACCCAAGATGTAGCACCGTCCACCTGGAGTTCTTCTTC<br />
TGAAACGAGCTTCGTGCTTTATGTGAGTAGTATGACCAGGAATCGATGCAAGCTTCTAATAGGAGGAATGGTTCCTACCTCAAATACCCTCCATGTT<br />
ACCCACCCCCTAGACCGCCTTTGGAGAACCACGTGGGAAGAACTATTTCCCACCCCCTACCTCGACGGACGCAGTTCGAAGCTAGTCCCTGGAGCAT<br />
GCGCAGTGACATCTCACCCTCCCCACCCCTCCCTTCACCCCACCCGGCTCCTGCATTAAGCCCCGGGTTCGCAGCAGCAGCCAGGATCGGGCACCCG<br />
GGGGCGGGCGGGCACAGTAGGGCCATGGCTGAGGGTGAGGATATGCAGACCTTCACTTCCATCATGGATGCACTAGTCCGCATCAGTACAAGCATGA<br />
AGAACATGGAGAAGGAACTGCTGTGCCCAGTGTGCCAAGAGATGTACAAGCAGCCACTAGTGCTGCCTTGTACCCACAACGTGTGCCAGGCCTGTGC<br />
CCGGGAGGTTTTGGGCCAGCAGGGGTACATAGGCCATGGTGGGGATCCGAGTTCGGAGCCCACTTCTCCTGCTTCCACCCCTTCTACCCGCAGCCCC<br />
CGCCTCTCTCGGAGAACTCTCCCCAAGCCAGATCGCTTGGACCGGCTCCTTAAGTCAGGCTTTGGGACATACCCTGGGCGGAAGCGTGGTGCCTTGC<br />
ACCCCCAGACGATCCTATTCCCGTGCCCAGCCTGCCAAGGCGATGTGGAGCTGGGGGAGAGGGGCCTTTCCGGGCTTTTCCGAAACCTGACCCTAGA<br />
GCGAGTGGTGGAGAGGTACCGCCAGAGTGTGAGTGTGGGAGGAGCCATCCTGTGCCAGTTGTGCAAGCCCCCACCACTAGAGGCCACCAAGGGCTGC<br />
ACAGAGTGTCGAGCTACCTTCTGTAACGAATGCTTCAAGCTCTTCCACCCCTGGGGCACTCAGAAGGCGCAGCATGAGCCCACGCTACCCACTCTTT<br />
CATTCCGCCCCAAGGGTCTGATGTGTCCAGACCACAAGGAAGAGGTGACCCACTACTGTAAGACATGTCAACGACTGGTGTGCCAACTCTGCAGAGT<br />
ACGGCGTACCCACAGTGGGCACAAGATCACACCAGTGCTCAGTGCCTACCAGGCCCTCAAGGATAAGCTAACAAAGAGCCTGGCATACATCTTGGGA<br />
AATCAGGACACTGTGCAGACCCAGATTTGTGAGCTGGAAGAGACCATCAGGCACACTGAGGTGAGTGGTCAGCAAGCAAAAGAGGAGGTGTCCCAGC<br />
TGGTTCGGGGACTAGGGGCTGTGCTGGAAGAGAAGCGGGCCTCACTGCTTCAGGCCATTGAAGAATGCCAGCAAGAGCGCTTATCCCGGCTCAGCGC<br />
CCAGATCCATGAACACCAGAGCCTGCTGGATGGCTCGGGTCTGGTGGGTTATGCGCAGGAAGTCCTTAAGGAAACAGACCAGCCTTGTTTTGTACAA<br />
GCAGCCAAACAGCTGCATAACAGGATTGCCCGAGCCACTGAGGCCCTCCAGACATTCCGGCCAGCTGCCAGCTCCTCCTTCCGCCACTGCCAGCTGG<br />
ATGTGGGGCGTGAGATGAAGCTGTTGACCGAGCTTAGCTTCCTGAGAGTGCCCGAGGCGCCCGTCATAGACACCCAACGCACCTTTGCCTATGATCA<br />
AATCTTCCTGTGCTGGCGGCTGCCCCCTCACTCACCACCTGCCTGGCATTACACCGTTGAGTTCCGGCGCACAGATGTCCCCGCCCAGCCAGGCCCT<br />
ACACGCTGGCAGCGCCGGGAAGAGGTGAGGGGCACCAGCGCCCTTCTTGAGAACCCCGACACGGGCTCTGTGTACGTGCTGCGTGTCCGTGGCTGCA<br />
ACAAGGCTGGCTACGGAGAGTACAGTGAAGATGTGCACCTGCACACACCCCCAGCCCCTGTCCTGCACTTCTTCCTTGATGGCCGCTGGGGTGCGAG<br />
CCGAGAGCGGCTAGCCATCAGCAAGGACCAGCGAGCGGTGCGGAGTATCCCAGGGCTTCCCTTGCTGCTGGCTGCTGAGCGGCTGCTCACGGGCTGC<br />
CACCTGAGTGTGGACGTGGTCTTGGGTGATGTGGCTGTGACCCAGGGCCGCAGCTACTGGGCCTGTGCGGTAGACCCTGCCTCCTACTTGGTCAAGG<br />
TGGGCGTCGGGCTGGAGAGCAAACTTCAGGAAAGCTTCCAGGGTGCCCCGGATGTGATCAGCCCCAGATACGACCCGGACAGTGGGCACGACAGCGG<br />
TGCCGAGGACGCTGCCGTGGAGGCGTTACCACCCTTTGCTTTCCTGACCATCGGCATGGGCAAGATCCTGCTGGGTTCCGGAGCGAGTTCCAATGCA<br />
GGGCTGACAGGGAGGGATGGCCCCACCGCCAGCTGCACAGTGCCCCTGCCACCCCGCCTAGGTATCTGTTTGGACTACGAGCGGGGGCGGGTCTCCT<br />
TCCTGGATGCCGTGTCCTTCCGTGGGCTGCTCGAGTGCCCCCTGGACTGCTCAGGGCCTGTGTGCCCTGCCTTCTGCTTCATTGGGGGTGGCGCTGT<br />
TCAGCTGCAGGAGCCCGTGGGCACCAAGCCTGAGAGGAAAGTCACCATTGGGGGCTTTGCCAAACTGGACTGAGCCGTTCAGGCCCCCTCTCAGACC<br />
TGAGTTCTGCTCCCCAAGTCTCTGGCATCGAGTTTGTTTTCCCAACAGCTTCTCTCCCAGACTTTCCCTAACCATGTGGCCCTGCCCCATACCTTGC<br />
CAGCGGTGTCTTCCCAGGGCTTCCCTTGACTAAGGGACTTTCCTCTGCTTCTCTCTGGATGTCCTTCATTCTCTGTGTTACCTGTTGGCCTAGGCCG<br />
CAGGCTCATCATGTCTCTGACCCAGGCCCCGCCCTTGGCATCATAACCAAGGCATAGAAAGCCCTGTTCCGTCCCTGGCCTGTGCTCCTGAGCCTTA<br />
CTGGGAGGGAGGGCACCTGGAACACTGGATATGACTAACAACTCTGCCCTTGCCTTGCCAAGCCCCCCTGCCCCACTAATGCTGACTGCAGCCTTGG<br />
CAGCCAGGCTTTGAGCCTCCCAGTGAGACAGAGGAGAACCTATCCTGTTTTATTTGGGTCCCTATACCCTCCAGCTGCATGTCCCTTCTGTCCCTCT<br />
TCTCCTCTTGCATGCTTTACCTATCCAGCACCCATGCCAACGTGCCAAGTCTCCCTTGGGAACTCAGTTAAGGCTGGTGTCCCCATTGGGTTGGGCC<br />
AAGCTAGGCCTCTGGTGCCTGCTACTGCCTCCGTACAGTGGGCATTGCTAGGCCTGTGCTGAGCAACAGCTGTAATTTTCATGGTTTATAAACAATA<br />
AACTGTGACACCAGGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA<br />
/translation="MQASNRRNGSYLKYPPCYPPPRPPLENHVGRTISHPLPRRTQFEASPWSMRSDISPSPPLPS<br />
PHPAPALSPGFAAAARIGHPGAGGHSRAMAEGEDMQTFTSIMDALVRISTSMKNMEKELLCPVCQEMYKQP<br />
LVLPCTHNVCQACAREVLGQQGYIGHGGDPSSEPTSPASTPSTRSPRLSRRTLPKPDRLDRLLKSGFGTYP<br />
GRKRGALHPQTILFPCPACQGDVELGERGLSGLFRNLTLERVVERYRQSVSVGGAILCQLCKPPPLEATKG<br />
CTECRATFCNECFKLFHPWGTQKAQHEPTLPTLSFRPKGLMCPDHKEEVTHYCKTCQRLVCQLCRVRRTHS<br />
GHKITPVLSAYQALKDKLTKSLAYILGNQDTVQTQICELEETIRHTEVSGQQAKEEVSQLVRGLGAVLEEK<br />
RASLLQAIEECQQERLSRLSAQIHEHQSLLDGSGLVGYAQEVLKETDQPCFVQAAKQLHNRIARATEALQT<br />
FRPAASSSFRHCQLDVGREMKLLTELSFLRVPEAPVIDTQRTFAYDQIFLCWRLPPHSPPAWHYTVEFRRT<br />
DVPAQPGPTRWQRREEVRGTSALLENPDTGSVYVLRVRGCNKAGYGEYSEDVHLHTPPAPVLHFFLDGRWG<br />
ASRERLAISKDQRAVRSIPGLPLLLAAERLLTGCHLSVDVVLGDVAVTQGRSYWACAVDPASYLVKVGVGL<br />
ESKLQESFQGAPDVISPRYDPDSGHDSGAEDAAVEALPPFAFLTIGMGKILLGSGASSNAGLTGRDGPTAS<br />
CTVPLPPRLGICLDYERGRVSFLDAVSFRGLLECPLDCSGPVCPAFCFIGGGAVQLQEPVGTKPERKVTIG<br />
GFAKLD*“<br />
849 AS-Reste.<br />
Zwar weisen <strong>die</strong> Proteine deutliche Größenunterschiede (537 versus 849 AS) auf, <strong>die</strong> Längen der<br />
mRNAs hingegen sind kaum verschieden. cDNA12 lässt sich durch den Einschub des 38 bp langen alternativen<br />
Exons 7b in cDNA4 überführen, was allerdings eine Verschiebung des Leserasters <strong>und</strong> ein vorzeitiges<br />
Stop-Codon bewirkt. Die etwas längere cNDA4 erzeugt dadurch das kürzere Protein. Ein<br />
Unterschied <strong>von</strong> 38 bp ist im Northern-Blot praktisch nicht auflösbar, so dass dort nur eine Bande<br />
erwartet würde (siehe Seite 52).
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