Identifizierung und Charakterisierung von neuen Genen für die ...
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Übersicht der 8 Splicevarianten <strong>von</strong> TRIM46<br />
Trim46-Genlokus Exon-Intron-Struktur:<br />
Exon 0<br />
ATG<br />
cDNA12 mit maximalem ORF:<br />
ATG-Ex0-----Ex1-Ex2----Ex3-Ex4--------Ex5-Ex6--------Ex7a---Ex8-------Ex9(Stop)<br />
ATG<br />
alternatives ATG<br />
Stop-Codon TGA (opal)<br />
alternatives Stop-Codon TAA (ochre) alternatives Stop-Codon TAG (amber)<br />
cDNA4 mit Exon 7b <strong>und</strong> vorzeitigem Ende:<br />
ATG-Ex0-----Ex1-Ex2----Ex3-Ex4--------Ex5-Ex6-Ex7b-Ex7a--Ex8-------Ex9(Stop)<br />
ATG<br />
Exon 2<br />
Exon 1<br />
Exon 4<br />
Exon 3<br />
Exon 6<br />
Exon 5<br />
alternatives ATG Stop-Codon TGA (opal)<br />
alternatives Stop-Codon TAA (ochre) alternatives Stop-Codon TAG (amber)<br />
cDNA12 <strong>und</strong> cDNA4 stellten <strong>die</strong> beiden am häufigsten gef<strong>und</strong>enen Splicevarianten dar <strong>von</strong> denen sich 2<br />
Protein-Isoformen ableiten, je nach Lage des Stop-Codons.<br />
Von cDNA4 gab es eine Variante ohne Exon 8, was <strong>für</strong> ein mögliches Protein jedoch irrelevant sein<br />
dürfte, da das Stop-Codon bereits im Exon 7a enthalten ist:<br />
cDNA7 mit Exon 7b <strong>und</strong> vorzeitigem Ende ohne Exon 8:<br />
alternatives Exon 7b<br />
Exon 7a<br />
alternatives Exon 8<br />
Exon 9<br />
alternatives ATG<br />
Stop-Codon TGA (opal)<br />
alternatives Stop-Codon TAA (ochre) alternatives Stop-Codon TAG (amber)<br />
ATG-Ex0-----Ex1-Ex2----Ex3-Ex4--------Ex5-Ex6-Ex7b-Ex7a------------Ex9(Stop)<br />
ATG<br />
alternatives ATG Stop-Codon TGA (opal)<br />
alternatives Stop-Codon TAA (ochre) alternatives Stop-Codon TAG (amber)
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