Identifizierung und Charakterisierung von neuen Genen für die ...
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CTCGCCCACTTCTTTCTCCTATGGGCCCTGCCTTGCCCACCCAGTGCCTAGAAAGTTCCT<br />
TTCCCCAGCTCCCTCACCTACACTCACCCCCCCGGCTCCCGCTGCTTCCTCTTTCCTGCC<br />
TGAACCACTCTCCGTGCCAGGTCCTGATTGACCCCATTGTCTCTTCCAACAGTGCCCGAG<br />
GCGCCCGTCATAGACACCCAACGCACCTTTGCCTATGATCAAATCTTCCTGTGCTGGCGG<br />
CTGCCCCCTCACTCACCACCTGCCTGGCATTACACCGTTGAGTTCCGGCGCACAGATGTC<br />
CCCGCCCAGCCAGGCCCTACACGCTGGCAGCGCCGGGAAGAGGTGAGGGGCACCAGCGCC<br />
CTTCTTGAGAACCCCGACACGGGCTCTGTGTACGTGCTGCGTGTCCGTGGCTGCAACAAG<br />
GCTGGCTACGGAGAGTACAGTGAAGATGTGCACCTGCACACACCCCCAGCCCCTGGTGAG<br />
TACACAGACAAGAGGCTTCATGTGGTGGACAGAGATGTTCACGCAGAGGGTATGGGATGG<br />
CCCAGGTACTCAGCTCAATCCCAATGGGCACCGGAAGAGCAGTGCAATACAATTTAATTT<br />
ATATAATTTGTACAATTTAATGTGTGAGTTGTACTCACTTCCTCTAGAGCTAGACTGCCC<br />
AGGTTCTAAGCCCACCTTTGCCCCTTGACAACTTTGTCTTGAGCCACATTTTTCTCCTTC<br />
TTTGAACTTCAGAGTCCTCTTCTACAGAAATAACAATAATATTTAATAGAGTGGTTTGGT<br />
AATGACACCATTATTAAATGGTACATATAAAGACCTAGCTTCTAGCCAGGCATGGTGGCA<br />
CACACCTTTAATCCCAGCACTCGGGAGGCAGAGTCAGGCGGATTTCTGAGTTCGAGGCCA<br />
GCATGGTCTACAGAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGGGCTACACAGAGAAACTCTGTCTCGA<br />
AAAACCAAAAAGAAAAAAAAAAGACCAAGCTTCTGCCTAGCTTCTGACTTATAGCAAGGG<br />
CTCAGTCAATGTTAGGGAGTGGCTTGTCAAGTGTGTTCAGCACTCGGGTGAAAGGGCTGG<br />
GTTGAGGGGTCAGGTATGGGCACCGGAGTGTGGGCTGAAAGGTCAGCGGCGTTAGGAATG<br />
GGACCAGGTGGAGCAGGACCATAGTGGAGATGGCCCACAGGCAAATCATGGAGAATGGGT<br />
TGCAGAAACATTGAGTTAGCTAGAGAAGGGACACTGCTTTCTCTGCCCACCGGTCCACTT<br />
TGGCTATTCCTGGCTTCCCGTGTCTGTTTGGGATGCCTCTCTCTTCCCTATGTCTCTATT<br />
TCAGTTTCCCACGCCTTATTCCCCTGGGCCCCTGCCAGCTCCTGGTGACTGAATTCCTTG<br />
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TCTTCCTTGATGGCCGCTGGGGTGCGAGCCGAGAGCGGCTAGCCATCAGCAAGGACCAGC<br />
GAGCGGTGCGGAGTATCCCAGGGCTTCCCTTGCTGCTGGCTGCTGAGCGGCTGCTCACGG<br />
GCTGCCACCTGAGTGTGGACGTGGTCTTGGGTGATGTGGCTGTGACCCAGGGCCGCAGCT<br />
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AGCCAGCCCGAGAGGCTTGTGGACGGAAGAGATGTGGGCTCAGCAGAAGGGACTTTGAGG<br />
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CGGAGCCTTACAGTGTAACCCCCTCAACATGTATTCACCTTAATACCTGCAACCGCCTGT<br />
CCCCCAACATCCTTCCAACATCCCACCCGGCTCCCTGACCCCACCCCACTCCCTTCCTCT<br />
GCCTCCCAGCATCTTTCTTCTGGATTCCCCCTCCTACAGATACGACCCGGACAGTGGGCA<br />
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GGATGGCCCCACCGCCAGCTGCACAGTGCCCCTGCCACCCCGCCTAGGTATCTGTTTGGA<br />
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GGCATCGAGTTTGTTTTCCCAACAGCTTCTCTCCCAGACTTTCCCTAACCATGTGGCCCT<br />
GCCCCATACCTTGCCAGCGGTGTCTTCCCAGGGCTTCCCTTGACTAAGGGACTTTCCTCT<br />
GCTTCTCTCTGGATGTCCTTCATTCTCTGTGTTACCTGTTGGCCTAGGCCGCAGGCTCAT<br />
CATGTCTCTGACCCAGGCCCCGCCCTTGGCATCATAACCAAGGCATAGAAAGCCCTGTTC<br />
CGTCCCTGGCCTGTGCTCCTGAGCCTTACTGGGAGGGAGGGCACCTGGAACACTGGATAT<br />
GACTAACAACTCTGCCCTTGCCTTGCCAAGCCCCCCTGCCCCACTAATGCTGACTGCAGC<br />
CTTGGCAGCCAGGCTTTGAGCCTCCCAGTGAGACAGAGGAGAACCTATCCTGTTTTATTT<br />
GGGTCCCTATACCCTCCAGCTGCATGTCCCTTCTGTCCCTCTTCTCCTCTTGCATGCTTT<br />
ACCTATCCAGCACCCATGCCAACGTGCCAAGTCTCCCTTGGGAACTCAGTTAAGGCTGGT<br />
GTCCCCATTGGGTTGGGCCAAGCTAGGCCTCTGGTGCCTGCTACTGCCTCCGTACAGTGG<br />
GCATTGCTAGGCCTGTGCTGAGCAACAGCTGTAATTTTCATGGTTTATAAACAATAAACT<br />
GTGACACCAGGCACATTTCTGTTTTCCTGGAGTGAGACCATTCCTGGTAATTTCTGGTCT<br />
GACCCATCGACACCCAAGGGTAGGGGGTCCTACTACACCTAAGCCCAGACTCCAACCGAC<br />
TCTCACCGCCAGGGGCCGCAGCACCGACTGCTAGCCTAGAACTTTACCTTGGGTGTCTGG<br />
ACCACAGACATGAACCCTGAGGGGATGTAACTGAGGGTGTGGCATGGTGTCGACCTAAAG<br />
GGGTCAGGGAACTAGAACCACTTCCTCATTCCGAGGGTGCCAGAGAGCCCACCCAGAGGC<br />
AGTGGCGGGTGGGGTGGCTGAGGGCCAGGGCCCGGTGCCAACAGCACCCGGATCTGTCCC<br />
AGCCCTGGCTTATCACTGCTGTGTTGACTCTGCTACTGTTATCTGTGGTCCAAGGATTTG<br />
CTTCACACCTGGACAGTTAAGAATAGAGCTGCGTTAAGGGCACTGTGCCAGTCGGAGAGG<br />
GGCAAGGGCTGGCCTCGGGAGAGAGTCATGGGCACGAGCTGAGGCCAGGTCTGGGGCAGG<br />
CCCACTGGAGCCAGCCTAAGTTTCATTTCCTCCTTCCTGCAGGGCCGCCAGGCACAGGAG<br />
AGAGGCAATTCCTCAGTTCTTTCTCAGGCCACCTCTGTGTCCCTGTGTCACCTCTTCCCC<br />
ATATCCCTGTTTTCGAATGAGGCCAGCCTTCCACCCCTCTGTGGCTCCTTGCCTTCGGGA<br />
GTCCTCCCCGAAAGGCCGCTTCCAGGCCCTTCATAGCTGAGTCCTGGCCGCTCTGACCCA<br />
AGAGTTGCAGATGAAAAACCACAGCTGGCATAACTAACAGGAGGCCATCTTTTATTCAGC<br />
TATGTTTGGGTTCCCATCCCTGTCTCCAGTTTTCCAGGCCAGTCCTTCTGAGAGCCACCA<br />
Exon 7a: War in allen cDNAs gleich <strong>und</strong> war<br />
etwas kürzer als <strong>die</strong> Vorhersage. Sofern<br />
Exon 7b in der cDNA vorlag, wurde das<br />
offene Leseraster in <strong>die</strong>sem Exon mit dem<br />
Stop-Codon TAG (amber) beendet.<br />
CpG-Insel. Bioinformatische vorhersage<br />
mittels Webgene.<br />
http://l25.itba.mi.cnr.it/cgi-bin/wwwcpg.pl<br />
Exon 8: Dieses Exon kam nicht in allen<br />
cDNAs vor. Ansonsten stimmte es mit der<br />
Vorhersage überein.<br />
CpG-Insel. Bioinformatische vorhersage<br />
mittels Webgene.<br />
http://l25.itba.mi.cnr.it/cgi-bin/wwwcpg.pl<br />
Exon 9: War in allen cDNAs gleich <strong>und</strong><br />
etwas kürzer als <strong>die</strong> Vorhersage. Enthielt das<br />
Stop-Codon TGA (opal) <strong>und</strong> den 3’-UTR.<br />
Falls Exon 8 fehlen sollte, käme ein früheres<br />
TGA zum Einsatz, sonst das zweite.<br />
Poly-A-Signal in fett, wie es bioinformatisch<br />
<strong>von</strong> WebGene vorhergesagt wurde.<br />
http://www.itb.cnr.it/sun/webgene/.<br />
In Kursiv der Bereich der 3’-Flanke <strong>für</strong> das<br />
spätere Knock-out-Konstrukt (nur ein kurzer<br />
Ausschnitt).
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