Identifizierung und Charakterisierung von neuen Genen für die ...

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Die Sequenz des IMAGE-Klons projizierte auf einen Bereich zwischen zwei bioinformatisch
vorhergesagten potentiellen Genen (TRIM46 und Krtcap2), von denen es einem zugeordnet werden sollte.
Hierzu wurden von anderen Sequenzabschnitten dieser beiden Gene Proben für in-situ-Hybridisierungen
kloniert und mit dem Muster von Klon 140 verglichen. Dabei ergaben die verwendeten Sonden für
Krtcap2 keine verwertbaren Muster im Gehirn, währenddessen eine Sonde von TRIM46 ebenfalls ein
deutliches Muster wie erwartet im Hippocampus zeigte (siehe ab Seite 116), zudem noch deutlicher und
mit weniger Hintergrund. Da TRIM46 einer viel versprechenden Proteinfamilie angehört, währenddessen
über Krtcap2 (Keratinozyten assoziiertes Protein 2) so gut wie gar nichts bekannt war (und wir uns primär
für das Gehirn und weniger Keratinozyten interessierten), war die Entscheidung nahe liegend, TRIM46 für
eine detaillierte Charakterisierung auszuwählen.
Abbildung 50: Das Chromosom 3 umfasst 158.945.675 bp, 1360 bekannte oder vorhergesagte Gene. Die projizierte
Sequenz liegt in dem Bereich höchster Gendichte (ganz links). Rechts ein Ausschnitt des projizierten Bereiches mit
vorhergesagten oder bekannten Genloci. Klon 140 stellt die rote senkrechte Linie dar zwischen TRIM46 und
Krtcap2. TRIM46 wird hier von rechts nach links abgelesen, Krtcap2 in umgekehrter Richtung. Im Chromosomendurchschnitt
sollten alle 117.000 bp ein Genlokus kommen. In diesem Bereich findet sich alle 11.000 bp einer, also
eine 10 Mal höhere Gendichte.