Untersuchungen zum Vorkommen und zur gesundheitlichen ...

2.3.4 Festlegung der Dominanz einzelner Isolate in einer Probe
Referenzisolate:
Nach dem Vergleich der makroskopischen, mikroskopischen und gegebenenfalls
chemotaxonomischen Merkmale der verschiedenen Actinomyceten-Typen wurde für
jeden Typ ein Isolat als das jeweilige Referenzisolat festgelegt. Dieses
Referenzisolat wurde zur anschließenden Bestimmung der 16S rRNA-Gensequenz
nach Gießen versandt. In der Liste der Isolate im Anhang Tabelle 3 sind die Isolate,
die nicht sequenziert wurden, mit * gekennzeichnet.
Insgesamt wurden die Dominanzstufen 1-3 festgelegt, von denen die Stufe 3 die
höchste Dominanz darstellte. Die Festlegung erfolgte nach mehreren Kriterien, da
die Anzahl der Isolate in der Probe sowie die Gesamtkonzentration der Proben sehr
große Unterschiede aufwiesen.
Dominanzklasse 3 (höchste Dominanz in einer Probe): Isolate der Dominanzklasse 3
müssen eine Konzentration von mindestens 10.000 KBE/g erreichen, außerdem
muss die Konzentration mindestens dem zweifachen Median entsprechen und über
bzw. gleich dem 75. Perzentil der Gesamtprobe liegen.
Dominanzklasse 2 (mittlere Dominanz): Isolate der Dominanzklasse 2 müssen eine
Konzentration von mindestens 1.000 KBE/g erreichen, außerdem muss die
Konzentration mindestens dem halben Median entsprechen und über bzw. gleich
dem 25. Perzentil der Gesamtprobe liegen.
Dominanzklasse 1 (geringste Dominanz): Ein Isolat wurde der Dominanzklasse 1
zugeordnet, wenn seine Konzentration unter den Kriterien der Dominanzstufe 2 lag.
2.3.5 Identifizierung der Actinomyceten
Die unterschiedlichen Actinomyceten-Typen wurden auf Subkultivierungsmedien
überimpft und mit dem Deckel der Petrischalen nach unten im Brutschrank im
Dunkeln bei (28 ± 2) °C bebrütet. Die Bebrütungsdauer betrug 10 Tage bis zu 3
Wochen.
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