Untersuchungen zum Vorkommen und zur gesundheitlichen ...
Untersuchungen zum Vorkommen und zur gesundheitlichen ...
Untersuchungen zum Vorkommen und zur gesundheitlichen ...
Sie wollen auch ein ePaper? Erhöhen Sie die Reichweite Ihrer Titel.
YUMPU macht aus Druck-PDFs automatisch weboptimierte ePaper, die Google liebt.
4.4 Diskussion Isolierung / Klonierung einschließlich deren Vergleich<br />
Die Actinomyceten in den Materialproben wurden sowohl mit Kultivierungsmethoden<br />
(2.3) isoliert, als auch mit molekularbiologischen Methoden (2.4.4) direkt bestimmt.<br />
Mit beiden Methoden, Isolierung <strong>und</strong> Klonierung wurden in 16 untersuchten<br />
Materialproben insgesamt 59 verschiedene Gattungen innerhalb der Klasse der<br />
Actinobacteria detektiert (Tab. 26). Davon wurden 10 Gattungen (17%) nur mittels<br />
Isolierung, 27 Gattungen (46%) nur mittels Klonierung <strong>und</strong> 22 Gattungen (37%) mit<br />
beiden Methoden erfasst. Insgesamt wurden jedoch nur 17 Gattungen (~30 %) mit<br />
beiden Analyseverfahren in derselben Probe detektiert.<br />
Tab. 26: Gegenüberstellung der mittels kultivierungsabhängiger <strong>und</strong><br />
kultivierungsunabhängiger Analyseverfahren detektierten Gattungen, sowie die<br />
ermittelten Übereinstimmungen bei den untersuchten Proben<br />
Nur Isolierung Nur Klonierung<br />
Isolierung <strong>und</strong><br />
Klonierung<br />
1 Citricoccus Actinomyces Agrococcus<br />
2 Corynebacterium Actinopolymorpha Amycolatopsis<br />
3 Isoptericola Aeromicrobium Arthrobacter<br />
4 Leucobacter Aeromonas Brachybacterium<br />
5 Micrococcus Agromyces Brevibacterium<br />
6 Oerskovia Blastococcus Jiangella<br />
7 Ornithinicoccus Conexibacter Kocuria<br />
8 Propionicicella Crocebacterium Kribella<br />
9 Saccharomonospora Crossiella Lentzea<br />
10 Tsukamurella Crustibacterium Microbacterium<br />
11 Cryocola Microlunatus<br />
12 Georgenia Micromonospora<br />
13 Goodfellowia Mycobacterium<br />
14 Leifsonia Nocardia<br />
15 Longispora Nocardioides<br />
16 Microcella Nocardiopsis<br />
17 Modestobacter Prauserella<br />
18 Parkia Promicromonospora<br />
19 Patulibacter Pseudonocardia<br />
20 Prauseria Rhodococcus<br />
21 Propionibacterium Saccharopolyspora<br />
22 Saccharothrix Streptomyces<br />
23 Sanguibacter<br />
24 Solirubrobacter<br />
25 Stackebrandtia<br />
26 Tetrasphaera<br />
27 Yania<br />
Da bei den untersuchten Klonsequenzen nur Teilsequenzen (ca. 400 bp) vorliegen,<br />
ist eine „phylogenetische“ Stammbaumberechnung aus diesen Daten nicht<br />
aussagekräftig genug. Daher wurde auch kein direkter Vergleich zwischen den<br />
vorliegenden 16S rRNA-Gen-Sequenzen der Isolate <strong>und</strong> der Klonsequenzen<br />
159