Untersuchungen zum Vorkommen und zur gesundheitlichen ...

3.1.5. Bestimmung von Enzymmustern mit dem API-ZYM System
Zu Beginn des Projektes wurden 33 Isolate mit den API-ZYM-Teststreifen mit dem
Ziel untersucht, ob das Nährmedium, von denen die Stämme isoliert wurden, einen
Einfluss auf die enzymatischen Leistungen der Stämme hat. Es wurden Isolate der
Gattungen Amycolatopsis (3), Pseudonocardia (3) und Streptomyces (26) untersucht
(s. Anhang). Besonders die Streptomyceten wiesen ein vielfältiges Enzymspektrum
auf. Nur 10 Streptomyces-Isolate wiesen vier verschiedene Enzymspektren auf. Drei
Isolate waren identisch in ihrer Esteraseaktivität, drei in ihrer α-
Galactosidaseaktivität, zwei in ihrer α- und β-Galactosidaseaktivität und zwei Isolate
in ihrer Esterase- und Lipaseaktivität.
Die drei Amycolatopsis- Isolate wurden von Gauze-Agar (2) bzw. Actinomyceten-
Agar isoliert. Die beiden Isolate vom Gauze-Agar unterschieden sich in 3 Enzymen.
Alle bildeten die Enzyme Esterase, Lipase und Valine arylamidase, waren aber
unterschiedlich bezüglich der Bildung der Esterase, β-Glucosidase und β-
Glucuronidase.
Die drei untersuchten Pseudonocardia-Isolate waren in ihrer Enzymaktivität sehr
ähnlich. Der von CM-Agar isolierte Stamm unterschied sich von den zwei von Gauze-
Agar isolierten in der fehlenden Bildung von β-Glucosidase.
Da die Isolate sehr unterschiedliche Enzymmuster aufwiesen, die weder
Rückschlüsse auf das Nährmedium zuließen noch eine eindeutige Gruppierung
aufgrund des Taxons erlaubten, wurden diese Tests nicht weitergeführt.
3.2 Kultivierungsunabhängige Untersuchungen
3.2.1 Klonierung
Die Bearbeitung der Klone erfolgte wie in Abschnitt 2.4.4 beschrieben.
Von insgesamt 1600 generierten Klonen aus 16 Proben konnten 694 16S rRNA Gen-
Inserts (45%) in die Klasse der Actinobacteria eingeordnet werden. Anhand der
BLAST ® -Suche wurden die analysierten Klonsequenzen 52 Gattungen der Klasse
der Actinobacteria zugeordnet (Tab. 21). Eine weitere Einordnung der 16S rRNA-
Gen-Inserts war aufgrund der geringen Länge der Sequenzen nicht möglich.
Insgesamt wurden jedoch Vertreter der Gattungen Amycolatopsis, Arthrobacter,
Jiangella, Nocardioides, Promicromonospora, Pseudonocardia, Saccharopolyspora
und Streptomyces am häufigsten detektiert. Bei 17 von 52 ermittelten Gattungen
konnte jeweils nur ein Vertreter detektiert werden (Tetrasphaera, Stackebrandtia,
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