Untersuchungen zum Vorkommen und zur gesundheitlichen ...

16S rRNA-Gens - aufgrund von Sequenzdaten geringer Qualität- keine Zuordnung
erlaubten.
Isolate mit meso-DAP ohne LL-DAP
Vertreter mycelbildender Gattungen mit meso-DAP in der Zellwand weisen
Menachinonmuster mit sowohl neun Isoprenoideinheiten [MK-9, MK-9(H2), MK-9(H4), MK-
9(H6) und MK-9(H8) in verschiedenen Verhältnissen], mit vorwiegend zehn
Isoprenoideinheiten [MK-10(H4), MK-10(H6), MK-10(H2)], sowie auch Menachinonmuster
mit unterschiedlicher Anzahl Isoprenoide mit gleichem Sättigungsgrad [MK-8(H4), MK-
9(H4), MK-10(H4) oder MK-8(H2), MK-9(H2)] auf. Zu ersterer Gruppe gehören die Vertreter
der Gattungen Amycolatopsis, Prauserella, Lentzea sowie alle Gattungen der Familien
Streptosporangiaceae und Thermomonosporaceae. Zur zweiten Gruppe gehören
Micromonospora, Glycomyces und allen Gattungen der Familie Nocardiopsaceae, und zu
letzterer gehören z.B. die Gattungen der Familie Pseudonocardiaceae. Wenige Gattungen
sind eindeutig durch die Menachinonmuster zu erkennen, wie z.B. die Gattungen Nocardia
bzw. Skermania, die das zyklische Menachinone MK-8(H4)cyclo aufweisen. Eine
Unterscheidung zwischen diesen beiden Gattungen erfolgt unter Berücksichtigung aller
morphologischen, chemotaxonomischen Daten und eindeutig auf molekularbiologischem
Wege (Chun et al., 1997).
Bei nicht mycelbildenden Isolaten mit meso-DAP ist die Analyse der Mycolsäuren wichtig
für die Identifizierung. Das Vorkommen von Mycolsäuren ist ausschließlich bei den
Gattungen mit meso-DAP von Bedeutung. Die Gattungen Corynebacterium,
Mycobacterium, Rhodococcus können anhand der Kettenlänge der Mycolsäuren
unterschieden werden (Collins et al., 1982) , andererseits besitzen Brachybacterium,
Brevibacterium und Janibacter keine Mycolsäuren, können aber anhand der Menachinone
[Brachybacterium MK-7, Brevibacterium MK-8(H2) MK-7(H2), Janibacter MK-8(H4)]
unterschieden werden.
Von den 26 Isolaten dieser Gruppe konnten aufgrund der chemotaxonomischen
Ergebnisse 21 einer Gattung zugeordnet werden, die anderen 5 Isolate konnten dagegen
nur einer Gruppe von Gattungen zugeordnet werden, da bei diesen Gattungen die
untersuchten chemotaxonomischen Merkmale gleich sind (Tab. 19). Durch die
Fettsäureanalytik mit Hilfe des MIDI-Systems konnten nur 4 Isolate identifiziert werden.
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