Untersuchungen zum Vorkommen und zur gesundheitlichen ...

3.1.4 Chemotaxonomische Untersuchungen
Chemotaxonomische Analysen wurden am HKI nur mit den Stämmen durchgeführt, die in
Jena isoliert wurden. Ziel war zu prüfen, ob chemotaxonomische Untersuchungen für eine
robuste und zuverlässige Identifizierung in Routineuntersuchungen anwendbar sind.
Durch die Detektion der Isomere der Diaminopimelinsäure (LL- bzw. meso-DAP) wurden
unbekannte Isolate zunächst in drei große Gruppen eingeteilt: In die Gruppe der
Gattungen mit LL-DAP, mit meso-DAP und ohne DAP.
Isolate mit LL-DAP
Zu den myzelbildenden Actinomyceten mit LL-DAP in der Zellwand gehören die Gattungen
der Familien Nocardioidaceae und Sporychthiaceae sowie die Familie Streptomycetaceae
mit den Gattungen Streptomyces und Kitasatospora. Stämme der letztgenannten Gattung
weisen sowohl LL- als auch meso-DAP auf. Vertreter dieser Gattungen besitzen
vorwiegend die Menachinone MK-9(H6), MK-9(H8), MK-9(H4). Eine weitere Differenzierung
zwischen diesen Gattungen ist nur unter Einbeziehung weiterer Merkmale wie z.B. der
Phagensensibilität (Streptomyces – Kitasatospora) oder durch molekularbiologische
Analytik möglich.
Von den 31 Isolaten mit LL-DAP wurden 27 auf Grund der Morphologie und der
chemotaxonomischen Analysen als Streptomyces sp. identifiziert. Bei 15 dieser
Streptomyces-Isolate wurde eine Analyse des 16S rRNA-Gens durchgeführt und diese
Zuordnung bestätigt, bei den übrigen 12 Isolaten wurde auf diese Analyse verzichtet. Auch
die Fettsäureanalytik der 27 Streptomyces-Isolate bestätigte die Zuordnung zur Gattung
Streptomyces (Tab. 18).
Vier Isolate mit LL-DAP gehörten nicht zu den Streptomyceten: Das Isolat 03-Je-020
wurde morphologisch und chemotaxonomisch als Nocardioides identifiziert, das Isolat 03-
Je-023 als Jiangella. Beide Zuordnungen wurden molekularbiologisch bestätigt. Bei Isolat
15-Je-017 wurde das vermutete Taxon Kribella molekularbiologisch nicht bestätigt, dieser
Stamm gehört ebenfalls zur Gattung Jiangella. Beide Gattungen wiesen das dominierende
Menachinon MK-9(H4) auf, im Unterschied zu Kribella findet man bei Jiangella LL-DAP
und Spuren meso-DAP in der Zellwand. In der MIDI-Datenbank sind beide Gattungen
nicht vertreten, sodass die Fettsäureanalytik keine Identifizierung ermöglichte. Ein Isolat
(03-Je-004) wurde nicht identifiziert, da die morphologischen und chemotaxonomischen
Daten (LL-DAP, MK-8, MK-8(H2), Fettsäuremuster A, I, T) sowie die Untersuchung des
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