Biochemie und Biotechnologie in der Schule: Hubertus ... - ChidS

3 Biotechnologie
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In diesem Fall wählt man Polyacrylamid. Sind die DNA Fragmente jedoch
größer, wählt man Agarose. Außer der DNA Proben gibt man noch einen DNA-
Marker in die Gelelektrophorese, dieser besitzt an verschiedenen Stellen
charakteristische Banden mit bekannter Bandenlänge (Basensequenzlänge).
Somit kann man die Länge der DNA-Proben besser bestimmen. Die
Grundvoraussetzung, dass DNA in einem elektrischen Feld überhaupt wandert,
bilden die Phosphatreste am 5´-Ende der DNA-Moleküle. Diese weisen eine
negative Ladung auf, so dass man DNA-Moleküle als Polyanionen ansehen
kann, die in einem elektrischen Feld immer Richtung Anode (Pluspol) wandern.
Nach der Gelelektrophorese wird das erhaltene Gel mit einem fluoreszierenden
Farbstoff versetzt. Dieser Farbstoff ist fast immer Ethidiumbromid, der sich
irreversibel in die DNA einbaut, er interkaliert. Auf Grund der fluoreszierenden
Eigenschaften von Ethidiumbromid können die DNA-Fragmente unter der UV-
Lampe sichtbar gemacht werden und anhand ihrer Lage die Länge bestimmt
werden. Da Ethidiumbromid allerdings ein Mutagen 25 ist, muss sehr sorgsam
damit umgegangen werden.
Abbildung 29 stellt die Struktur von Ethidiumbromid dar.
Abb. 29: Struktur Ethidiumbromid
25 Mutagen = Stoffe die sich irreversibel in die DNA einlagern und sie verändern.
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