Dokument 1.pdf - OPUS - Friedrich-Alexander-Universität Erlangen ...
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II. 3. Diskussion<br />
schiedliche Gene vergleichbar ist, und somit ein standardisiertes Screening-Protokoll<br />
möglich ist. 4. Die Tribolium-Community hat jahrelange Erfahrung mit pupaler, nicht<br />
aber mit adulter RNAi.<br />
Somit muss auch im pupalen Screen diese Einschränkung der Effektivität zu-<br />
gunsten der Gesamt-Performance in Kauf genommen werden.<br />
3.2.4. Der Pilot-Screen suggeriert eine hohe Zahl an Tribolium-Genen<br />
deren Verlust zu Letalität in unterschiedlichen Stadien führt<br />
Wie bereits erwähnt, konnten bereits im Laufe des Prescreens etliche neue Phä-<br />
notypen detektiert werden. Unter Berücksichtigung der Injektionen, die bald nach der<br />
Injektion zur Letalität der injizierten Tiere ohne interessante Phänotypen führten,<br />
zogen insgesamt 55 % der Injektionen Letalität in unterschiedlichen Entwicklungs-<br />
stadien nach sich. 33 % führten dabei zu für den Screen interessanten Phänotypen.<br />
Dies ist zunächst erfreulich, da dies zeigt, dass iBeetle mit hoher Effizienz Phänoty-<br />
pen erzeugen wird. Allerdings scheint dieser Wert im Verhältnis zu Studien in ande-<br />
ren Arten sehr hoch zu sein. So geht man beispielsweise davon aus, dass nur ca. ein<br />
Drittel aller Drosophila-Gene zu Letalität mutieren kann (Nüsslein-Volhard, 1994;<br />
Miklos und Rubin, 1996).<br />
Prinzipiell ist durchaus denkbar, dass zwischen Tribolium und Drosophila Unter-<br />
schiede in der Zahl der essentiellen Loci bestehen. So wäre es möglich, dass in<br />
Drosophila ein höherer Redundanz-Level die Zahl an zu Letalität mutierbaren Genen<br />
im Vergleich zu Tribolium reduziert, und somit die Diskrepanz dieser Zahlen auf<br />
tatsächliche biologische Unterschiede beider Arten hinweisen.<br />
Man muss allerdings davon ausgehen, dass die hier verglichenen Zahlen vermut-<br />
lich durch diverse Umstände beeinflusst werden, und die Diskrepanz in Wirklichkeit<br />
weniger ausgeprägt ist. So fokussierten die klassischen Drosophila-Screens der<br />
Vergangenheit beispielsweise entweder auf zygotische oder maternale Genfunktio-<br />
nen (Gans et al., 1975; Nüsslein-Volhard und Wieschaus, 1980; Nüsslein-Volhard et<br />
al., 1987; Schüpbach und Wieschaus, 1989; St Johnston und Nüsslein-Volhard,<br />
1992), während parentale RNAi in Tribolium beides gleichermaßen betrifft (Schinko<br />
et al., 2008). Außerdem werden in iBeetle innerhalb eines genomweiten Screens<br />
mehrere sowohl embryonale als auch post-embryonale Prozesse untersucht, wobei<br />
Screens in Drosophila häufig auf einen bestimmten Entwicklungsprozess (z.B. Gao<br />
et al., 1999) und oft einen genomischen Bereich fokussierten (z.B. Lewis et al.,<br />
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