1 Menneskets genom
1 Menneskets genom 1 Menneskets genom
18209 01.fm7 Page 18 Friday, March 3, 2006 12:37 PM 1 Menneskets genom 2) RNA indeholder ikke thymin, men i stedet pyrimidinen uracil, som ligeledes er komplementær til adenin, og 3) RNA-molekyler er enkeltstrengede, men indeholder oftest korte strækninger af nukleotider som baseparrer med komplementære sekvenser andre steder i molekylet (Figur 1.4C). Pakning af DNA til kromosomer Kromosomerne gennem cellecyklus Kromosomer afbildes næsten altid i en tilstand hvor kromatinet, dvs. DNA og associerede proteiner, er mest kompakt. Denne tilstand optræder kun i en meget kort periode af cellens livscyklus, nemlig i metafasen i celledelingen (Figur 1.5 og 1.6; se også Kapitel 2). På alle andre tidspunkter ligger kromosomerne som lange, tynde og fine tråde i cellekernen, og kan kun vanskeligt visualiseres i mikroskopet. Et kromosom fungerer som en strukturel enhed i cellen, og hvert enkelt kromosom ligger i et afgrænset afsnit ( compartment) i cellekernen (Figur 1.6). 18 Figur 1.5 Spredte kromosomer fra en celle i metafasen efter Giemsa-farvning, hvor man kan se lyse og mørke bånd langs de enkelte kromosomer. Parvis er kromosomernes båndmønster ens undtagen for X- og Y-kromosomerne. Tallene angiver eksempler på kromosompar, her nr. 1 og 13 samt kønskromosomerne X og Y. Hvert kromatid (G1-fase-kromosom/G2-fa se-kromosomhalvdel – se Figur 2.1) indeholder ét langt, lineært, dobbeltstrenget DNA-molekyle som er mange millioner basepar langt. Figur 1.6 Til venstre er vist en FISH-farvning af metafase-kromosomer fra dyrkede lymfocytter med whole chromosome painting-prober for kromosom 2 (rød) og kromosom 16 (grøn) (Se Kap. 4 for beskrivelse af FISH-farvning). Kontrastfarven er 4’,6-diamidino-2-fenylindol (DAPI), som farver de øvrige kromosomer (blå). Til højre er vist en cellekerne, hvor man kan se de enkelte kromosomer (2 og 16) liggende i hvert sit compartment. De øvrige kromosomer kan ikke ses individuelt, men er kontrastfarvet blå.
18209 01.fm7 Page 19 Friday, March 3, 2006 12:37 PM Længden af det enkelte DNA-molekyle afhænger af størrelsen af kromosomet som vist i Tabel 1.1. Kromosomstrukturen og graden af kromosomernes kondensering varierer med cellecyklus (se Mitosen, side 52), og man skelner på den baggrund mellem mitotiske kromosomer og interfasekromosomer. Pakning af DNA til kromosomer Tabel 1.1 Det haploide humane genom. DNA-indholdet samt antallet funktionelle gener i hvert kromosom. Fra National Center for Biotechnology Information (NCBI) Human Genome Project, november 2005 Kromosom Mb % af genomet Samlede antal gener Antal Gener/Mb * % af gener i alt 1 246 8,0 2610 10,6 9,7 2 243 7,9 1748 7,2 6,5 3 200 6,5 1381 6,9 5,2 4 191 6,2 1024 5,4 3,8 5 189 6,1 1190 6,3 4,4 6 171 5,5 1394 8,2 5,2 7 159 5,1 1378 8,7 5,1 8 146 4,7 927 6,3 3,5 9 138 4,5 1076 7,8 4,0 10 135 4,4 983 7,3 3,7 11 135 4,4 1692 12,5 6,3 12 132 4,3 1268 9,6 4,7 13 114 3,7 496 4,3 1,9 14 106 3,4 1173 11,0 4,4 15 100 3,3 906 9,0 3,4 16 89 2,9 1032 11,6 3,8 17 79 2,6 1394 17,7 5,2 18 76 2,5 400 5,3 1,5 19 64 2,1 1592 25,0 5,9 20 62 2,0 710 11,4 2,6 21 47 1,5 337 7,2 1,3 22 50 1,6 701 14,1 2,6 X 155 5,0 1141 7,4 4,3 Y 58 1,9 255 4,4 1,0 3085 100,0 26808 8,7 100,0 * Bemærk variationen i gen-tætheden på de enkelte kromosomer Interfasekromosomer og kromatindomæner Den samlede længde af alle 46 DNA-molekyler i en cellekerne i G1-fasen er ca. 2 meter. De er pakket i en cellekerne som for en typisk menneskecelle vil være omkring 5-8 µm i diameter. Omregnet svarer det til at hvis man forestiller sig cellekernen på størrelse med en tennisbold 19
- Page 1 and 2: 18209 01.fm7 Page 13 Friday, March
- Page 3 and 4: 18209 01.fm7 Page 15 Friday, March
- Page 5: 18209 01.fm7 Page 17 Friday, March
- Page 9 and 10: 18209 01.fm7 Page 21 Friday, March
- Page 11 and 12: 18209 01.fm7 Page 23 Friday, March
- Page 13 and 14: 18209 01.fm7 Page 25 Friday, March
- Page 15 and 16: 18209 01.fm7 Page 27 Friday, March
- Page 17 and 18: 18209 01.fm7 Page 29 Friday, March
- Page 19 and 20: 18209 01.fm7 Page 31 Friday, March
- Page 21 and 22: 18209 01.fm7 Page 33 Friday, March
- Page 23 and 24: 18209 01.fm7 Page 35 Friday, March
- Page 25 and 26: 18209 01.fm7 Page 37 Friday, March
- Page 27 and 28: 18209 01.fm7 Page 39 Friday, March
- Page 29 and 30: 18209 01.fm7 Page 41 Friday, March
- Page 31 and 32: 18209 01.fm7 Page 43 Friday, March
- Page 33 and 34: 18209 01.fm7 Page 45 Friday, March
- Page 35 and 36: 18209 01.fm7 Page 47 Friday, March
- Page 37 and 38: 18209 01.fm7 Page 49 Friday, March
18209 01.fm7 Page 19 Friday, March 3, 2006 12:37 PM<br />
Længden af det enkelte DNA-molekyle afhænger<br />
af størrelsen af kromosomet som vist i Tabel<br />
1.1.<br />
Kromosomstrukturen og graden af kromosomernes<br />
kondensering varierer med cellecyklus<br />
(se Mitosen, side 52), og man skelner på<br />
den baggrund mellem mitotiske kromosomer<br />
og interfasekromosomer.<br />
Pakning af DNA til kromosomer<br />
Tabel 1.1 Det haploide humane <strong>genom</strong>. DNA-indholdet samt antallet funktionelle gener i hvert<br />
kromosom.<br />
Fra National Center for Biotechnology Information (NCBI) Human Genome Project, november 2005<br />
Kromosom Mb % af <strong>genom</strong>et Samlede antal gener Antal Gener/Mb * % af gener i alt<br />
1 246 8,0 2610 10,6 9,7<br />
2 243 7,9 1748 7,2 6,5<br />
3 200 6,5 1381 6,9 5,2<br />
4 191 6,2 1024 5,4 3,8<br />
5 189 6,1 1190 6,3 4,4<br />
6 171 5,5 1394 8,2 5,2<br />
7 159 5,1 1378 8,7 5,1<br />
8 146 4,7 927 6,3 3,5<br />
9 138 4,5 1076 7,8 4,0<br />
10 135 4,4 983 7,3 3,7<br />
11 135 4,4 1692 12,5 6,3<br />
12 132 4,3 1268 9,6 4,7<br />
13 114 3,7 496 4,3 1,9<br />
14 106 3,4 1173 11,0 4,4<br />
15 100 3,3 906 9,0 3,4<br />
16 89 2,9 1032 11,6 3,8<br />
17 79 2,6 1394 17,7 5,2<br />
18 76 2,5 400 5,3 1,5<br />
19 64 2,1 1592 25,0 5,9<br />
20 62 2,0 710 11,4 2,6<br />
21 47 1,5 337 7,2 1,3<br />
22 50 1,6 701 14,1 2,6<br />
X 155 5,0 1141 7,4 4,3<br />
Y 58 1,9 255 4,4 1,0<br />
3085 100,0 26808 8,7 100,0<br />
* Bemærk variationen i gen-tætheden på de enkelte kromosomer<br />
Interfasekromosomer og kromatindomæner<br />
Den samlede længde af alle 46 DNA-molekyler<br />
i en cellekerne i G1-fasen er ca. 2 meter. De er<br />
pakket i en cellekerne som for en typisk menneskecelle<br />
vil være omkring 5-8 µm i diameter.<br />
Omregnet svarer det til at hvis man forestiller<br />
sig cellekernen på størrelse med en tennisbold<br />
19
Change language