1 Menneskets genom

18209 01.fm7 Page 17 Friday, March 3, 2006 12:37 PM
A
B
HOCH2 O OH
H
H H
H
OH OH
Ribose
O
HC
C
NH
HC
N
H
C
Uracil
O
HOCH 2 O OH
H
H H
OH H
H
Deoxyribose
H 3 C
Når to DNA-strenge ved baseparring associeres
til en DNA-dobbelthelix sker det i modsat
orientering, hvilket vil sige at hvis den ene
streng fx er orienteret i 5'→3'-retning
så vil den
anden streng orienteres i 3'→5'-retning;
de er
antiparallelle, som vist i Figur 1.3A. Nomenklaturen
for retningen skyldes, at nukleotiderne
under syntesen af DNA-strengen bindes sammen
af esterbindingen mellem den fri OHgruppe
i det sidst indbyggede nukleotid og fosfatgruppen
i det ny. Den fri OH-gruppe sidder
på det C-atom i deoxyribosen der betegnes
med 3' og definerer dermed DNA-strengens 3'ende.
Tilsvarende defineres 5'-enden af den fri
fosfatgruppe på deoxyribosens 5'-C.
En DNA-streng består således af en lang række
enheder (nukleotider), som hver igen består
af følgende tre elementer: 1) deoxyribose, som
er et kulhydrat med 5 C-atomer (en pentose),
hvortil der dels er bundet 2) en nitrogenholdig
base (A, G, C eller T), dels 3) en fosfatgruppe.
Cytosin og thymin tilhører pyrimidingruppen af
baser, der er opbygget af en sekskantet pyrimi-
C
HC
O
C
NH
C
ON
H
Thymin
C
5' 3'
Nukleinsyrernes opbygning
Figur 1.4 Strukturelle forskelle mellem RNA og DNA.
A. RNA indeholder kulhydratet ribose, som svarer til DNA’ets deoxyribose, men ribosen har en ekstra OH-gruppe.
B. RNA indeholder basen uracil, som ligner thymin, men mangler CH3-gruppen. C. I RNA er nukleotiderne som i DNA
koblet sammen med 3'-5' fosfodiester-bindinger. I modsætning til DNA er RNA enkeltstrenget, men indeholder ofte
korte strækninger af nukleotider som baseparrer med komplementære sekvenser andre steder i samme molekyle ( ).
Dette medfører at et RNA-molekyle kan foldes i en tredimensionel struktur bestemt af nukleotidsekvensen.
G
U
A
U
C
C
A
U
A
G
dinring, mens guanin og adenin tilhører puringruppen,
som har en femkantet ring koblet til
den sekskantede (se Figur 1.3B).
RNA
RNA-molekyler er polynukleotider, ligesom
DNA-molekylet, men adskiller sig på tre væsentlige
punkter fra DNA (Figur 1.4): 1) kulhydrat-molekylet
i RNA-nukleotiderne er ribose,
Boks 1.1
Længdeenheder i DNA- og RNA-molekyler
Da DNA er dobbeltstrenget, angives længden af molekylerne
i antal basepar (bp). Et kilobasepar (kb) er
103 bp og et megabasepar (Mb) er 106 bp. Et gigabasepar
(Gb) er 109 bp.
1 kb = 1000 bp
1Mb = 1000 kb = 1.000.000 bp
1 Gb = 1000 Mb = 1.000.000 kb = 1.000.000.000 bp
Længden af RNA-molekyler kan ikke udtrykkes i bp, da
de er enkeltstrengede, hvorfor længden angives i antal
nukleotider.
17