Cytogenetisk diagnostik – nu og i fremtiden
Cytogenetisk diagnostik – nu og i fremtiden Cytogenetisk diagnostik – nu og i fremtiden
Cytogenetisk diagnostik – nu og i fremtiden Seniorforsker Maria Kirchhoff Kromosomlaboratoriet, Rigshospitalet
- Page 2 and 3: Numeriske kromosomfejl • Trisomi
- Page 4 and 5: Karyotype (G-bånd), foster med tri
- Page 7 and 8: Fluorescense In Situ Hybridisation
- Page 10 and 11: Analyser på Kromosomlaboratoriet K
- Page 12: Nuværende MLPA analyser på Kromos
- Page 30: 21-38 kb 33-49 kb 12-26 kb
- Page 36 and 37: Dup 17q25.1qter 9 Mb
- Page 38 and 39: del 1q41, del 12p11.1 del 1q41, del
- Page 42 and 43: Kliniske manifestationer • Henvis
- Page 44 and 45: Kliniske manifestationer • Forsin
- Page 46: Prænatal prøve fra OUH Kromosom-P
<strong>Cyt<strong>og</strong>enetisk</strong> <strong>diagnostik</strong><br />
<strong>–</strong> <strong>nu</strong> <strong>og</strong> i <strong>fremtiden</strong><br />
Seniorforsker Maria Kirchhoff<br />
Kromosomlaboratoriet, Rigshospitalet
Numeriske kromosomfejl<br />
• Trisomi<br />
• Monosomi<br />
Ubalancerede<br />
• Marker-kromosom<br />
•Polyploidi<br />
Strukturelle kromosomfejl<br />
• Deletion<br />
• Duplikation<br />
• Translokation<br />
• Inversion<br />
• Insertion<br />
Ubalancerede<br />
Ubalanceret/balanceret<br />
Balancerede
Analyser på Kromosomlaboratoriet<br />
Konventionel karyotypering (G-bånd)<br />
FISH-undersøgelse<br />
Kromosom-PCR/Diagnostisk PCR (MLPA)<br />
Array komparativ genomisk hybridisering (aCGH)
Karyotype (G-bånd), foster med trisomi 21
Balanceret t(2;14)
Fluorescense In Situ Hybridisation (FISH)
FISH undersøgelse for 22q11 syndrom<br />
negativ positiv
Analyser på Kromosomlaboratoriet<br />
Konventionel karyotypering (G-bånd)<br />
FISH-undersøgelse<br />
Kromosom-PCR/Diagnostisk PCR (MLPA)<br />
Array komparativ genomisk hybridisering (aCGH)
MLPA<br />
Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification<br />
Relativ kvantificering af 40-50 DNA sekvenser i en reaktion<br />
- oprenset DNA<br />
- kun påvisning af ubalancerede kromosomfejl
Nuværende MLPA analyser på<br />
Kromosomlaboratoriet<br />
til prænatal <strong>diagnostik</strong><br />
Kromosom PCR: 13, 18, 21, X, Y<br />
Diagnostisk MLPA:<br />
Syndrom: 1p36-deletion, Williams, Prader-Willi,<br />
Angelman, Miller-Dieker, Smith-Magenis, 22q11-deletion<br />
Subtelomer: Alle kromosom-ender på nær acrocentriske p-arme
244k Agilent oligoarray<br />
Udgøres af ca. 244.000 60-mer oligoprober<br />
Syntetiseres direkte på glasset<br />
Dækker kodende <strong>og</strong> ikke-kodende<br />
sekvenser med en gennemsnitsafstand<br />
på hhv. 7.4 kb <strong>og</strong> 15.4 kb<br />
Dækker alle subtelomerområder på<br />
nær X/Yp <strong>og</strong> X/Yq<br />
Kan påvise deletioner/duplikationer<br />
i områder, der er associeret med<br />
kendte mikrodeletionssyndromer<br />
Følsomhed ca. 0.03-0.3 Mb
21-38 kb 33-49 kb<br />
12-26 kb
Undersøgelser på forældreblodprøver efter<br />
abnormt array-CGH fund hos barn<br />
• Kvantitativ PCR<br />
• MLPA (kendte syndromer)<br />
• Metafase FISH
Dup 17q25.1qter<br />
9 Mb
95 = 16 %<br />
491 = 84 % (1050)<br />
586 aCGH analyser<br />
Normal<br />
Ubalanceret<br />
165 = 28 % (429) (221)<br />
48 (36) 108 (82)<br />
65 (53)<br />
326 = 56 % (621)<br />
Nedarvede<br />
De novo<br />
?<br />
"Normal"<br />
Abnorm
del 1q41,<br />
del 12p11.1<br />
del 1q41,<br />
del 12p11.1,<br />
dup12q24.13q24.21<br />
del 1q41,<br />
del 2q21.2,<br />
del 12p11.1,<br />
dup12q24.13q24.21<br />
del 13q32.1 de novo<br />
dup12q24.13q24.21<br />
del 2q21.2
Rasmus 2 år<br />
Duplikation 15q24<br />
~ 1.7 Mb
Kliniske manifestationer<br />
• Henvist 9 mdr. gl. pga af forsinket udvikling<br />
• Hypoton, passiv, dysmorfe ansigtstræk<br />
• 3 år: selvdestruktiv, aggressiv, umotiverede<br />
vredesudbrud, søvnproblemer, obstipation,<br />
væksthæmning, hørenedsættelse<br />
• Urinvejsmisdannelser<br />
• Kalveknæet
Deletion 17p11.2 de novo ~ 3.5 Mb<br />
Smith-Magenis syndrom
Kliniske manifestationer<br />
• Forsinket udvikling<br />
•Ataxi<br />
• Hyperaktiv, let distraherbar, frygtløs<br />
• Konvergent skelen<br />
• CT- <strong>og</strong> MR scanning af cerebrum<br />
normal (5 år)<br />
• Behandles med Ritalin
Del 10q26.2qter<br />
~ 6 Mb<br />
Dup 8q24.3qter<br />
~ 3 Mb
Prænatal prøve fra OUH<br />
Kromosom-PCR havde vist<br />
deletion af to prober for<br />
kromosom 21
Change language