ÐÐСÐЫРРÐÐÐÐÐЫРÐЫШРÐолекÑлÑÑно-генеÑиÑеÑкие ...
ÐÐСÐЫРРÐÐÐÐÐЫРÐЫШРÐолекÑлÑÑно-генеÑиÑеÑкие ... ÐÐСÐЫРРÐÐÐÐÐЫРÐЫШРÐолекÑлÑÑно-генеÑиÑеÑкие ...
Молекулярная эволюция, филогения и систематика по данным полиморфизма длин...тельность, тем реже происходят разрывы ДНК. Но практическивсегда обработка эукариотической ДНК рестриктазами приводитк образованию множества фрагментов. Если гель, на которомразделяют продукты гидролиза, прокалибровать, можно определитьдлину любого индивидуального фрагмента ДНК. Для этого водну из дорожек наносят смесь стандартных фрагментов известногоразмера (маркеров). Соотношение между размером исследуемогофрагмента и пройденным им расстоянием устанавливаютпо скорости миграции маркеров.Открытие В. Ботштейном в 1980 г. с помощью рестриктазнового генетического полиморфизма — полиморфизма длин рестрикционныхфрагментов (ПДРФ или RFLP) (DowIIng et al., 1990)дало возможность изучать свойства и наследование конкретныхпоследовательностей ДНК. Анализ последовательностей геномнойДНК позволяет маркировать различные участки хромосом и картироватьгены. Метод рестрикционного анализа яДНК в егооригинальном исполнении является достаточно удобным длямежвидовых сравнений в силу своей простоты, информативностии внутривидовой стабильности выявляемых признаков. Перспективностьтакого подхода убедительно продемонстрирована работамиД. Джиллеспи с соавторами (1986), исследовавшими геномыприматов, и подтверждена другими авторами, изучавшими геномырыб (Шубина, Медников, 1986) и млекопитающих (Ilma-de-Faria et al., 1984; Лушникова и др., 1989). Оказалось, что некоторыеповторяющиеся последовательности являются консервативнымив эволюции и могут принадлежать к таксонам высокогоранга (семейство, класс, отряд). Другие эволюционируют значительнобыстрее и могут быть видоспецифичными. На основаниирезультатов рестрикционного анализа, таким образом, можно судитьоб эволюции различных последовательностей ДНК, генома ивида в целом.Нами проведен сравнительный анализ двух семейств повторяющейсяДНК лесных и полевых мышей группы «Apodemus»,выщепляемых нуклеазами рестрикции (рестриктазами) EcoRI-(диспергированные повторы) и НпкПП-(сатДНК), впервые описанныхв 1975 г. Н. Куком (Cooke, 1975). Несмотря на то что ужебыла опубликована серия работ (Cooke, 1975; Brown, Dover, 1979,1981; Hirning et al., 1989) по исследованию физико-химическихсвойств, структурной организации и локализации этих последова-19
ГЛАВА 1тельностей на хромосомах, тема оставалась далеко не исчерпанной.Так, за пределами внимания оказались некоторые восточноевропейскиеи азиатские формы. Нами были поэтому протестированывначале геномы шести видов лесных и полевых мышей:желтогорлой Sylvaemus flavicollls, европейской S. sy/vaticus, малойS. uralensis, восточноазиатской Apodemus peninsulae, японской(красной) A. speciosus и A. agrarius. Параллельно вели анализ ядернойДНК домовой мыши Mus musculus L., 1758 и серой крысыRattus norvegicus Bercenhout, 1769, представляющих два других родасемейства Muridae (Челомина, 1993а).На рис. 3 представлена картина электрофоретического разделенияяДНК грызунов гидролизованной рестриктазой EcoRI.Наиболее яркая полоса электрофореграммы представляет семействоповторяющихся последовательностей длиной 1,85 тыс. пн(тпн), обнаруженное ранее в геномах лесных и полевых мышейПольши и Британских островов и признанное родоспецифичным(Cooke, 1975; Brown, Dover, 1981). Согласно данным денситометрии,на его долю в геноме каждого проанализированного намивида приходится примерно одинаковое количество ДНК — около2,2 %, что предполагает копийность, равную (8,8—9,7)х10 4 , таккак размер генома лесных и полевых мышей составляет 8,3—9,1 пг(Gamperl et al., 1982).В отличие от родоспецифичного EcoRI-повтора количестводиспергированных повторяющихся последовательностей длиной1,35 тпн, идентифицированных в геномах лесных мышей ЗападнойЕвропы (Cooke, 1975), а также домовой мыши и крыс(Brown, Dover, 1979, 1981; Hirning et el., 1989; Gamperi et al.,1982; Miklos et al., 1980) (т. е. специфичных, очевидно, для тактсона более высокого ранга), в разных видах отличается. В геномахS. flavicollls, S. sylvaticus, S. uralensis оно максимально и составляет1,8—2,0 %, A. peninsulae — значительно ниже (не выше0,5 %), а у A. speciosus и A. agrarius этот повтор не обнаруживаетсявообще или представлен минимальным количеством копий (регистрациякоторых невозможна из-за ограничений в чувствительностиметода). По имеющимся в литературе сведениям (Brown, Dover,1981), он отсутствует в EcoRI-гидролизатах ДНК A. mystacinus(горная малоазийская мышь) и европейских форм A. agrarius.Максимальная частота повторяемости 1,35 тпн EcoRI-последовательностисоставляет (3—6)х10 4на геном. В яДНК других гры-20
- Page 3 and 4: РОССИЙСКАЯ АКАДЕМИ
- Page 5 and 6: ПредисловиеПосле о
- Page 7 and 8: кулярно-генетическ
- Page 9 and 10: витии теории молек
- Page 11: ГЛАВА 1МОЛЕКУЛЯРНА
- Page 14 and 15: Молекулярная эволю
- Page 16 and 17: Молекулярная эволю
- Page 21 and 22: ГЛАВА 1Dover, 1981) и (2,4-5)
- Page 24 and 25: Молекулярная эволю
- Page 26 and 27: Молекулярная эволю
- Page 28 and 29: Молекулярная эволю
- Page 30 and 31: Молекулярная эволю
- Page 32: Молекулярная эволю
- Page 35 and 36: ГЛАВА 14. Интенсивно
- Page 37 and 38: ГЛАВА 1детельством
- Page 40 and 41: Молекулярная эволю
- Page 42 and 43: Молекулярная эволю
- Page 45 and 46: ГЛАВА 1ференциация
- Page 47: ГЛАВА 1Alul-фрагменты
- Page 50 and 51: Молекулярная эволю
- Page 52 and 53: Молекулярная эволю
- Page 54 and 55: ^Молекулярная эвол
- Page 56 and 57: Молекулярная эволю
- Page 58 and 59: Молекулярная эволю
- Page 62 and 63: Молекулярная эволю
- Page 64: Молекулярная эволю
ГЛАВА 1тельностей на хромосомах, тема оставалась далеко не исчерпанной.Так, за пределами внимания оказались некоторые восточноевропейскиеи азиатские формы. Нами были поэтому протестированывначале геномы шести видов лесных и полевых мышей:желтогорлой Sylvaemus flavicollls, европейской S. sy/vaticus, малойS. uralensis, восточноазиатской Apodemus peninsulae, японской(красной) A. speciosus и A. agrarius. Параллельно вели анализ ядернойДНК домовой мыши Mus musculus L., 1758 и серой крысыRattus norvegicus Bercenhout, 1769, представляющих два других родасемейства Muridae (Челомина, 1993а).На рис. 3 представлена картина электрофоретического разделенияяДНК грызунов гидролизованной рестриктазой EcoRI.Наиболее яркая полоса электрофореграммы представляет семействоповторяющихся последовательностей длиной 1,85 тыс. пн(тпн), обнаруженное ранее в геномах лесных и полевых мышейПольши и Британских островов и признанное родоспецифичным(Cooke, 1975; Brown, Dover, 1981). Согласно данным денситометрии,на его долю в геноме каждого проанализированного намивида приходится примерно одинаковое количество ДНК — около2,2 %, что предполагает копийность, равную (8,8—9,7)х10 4 , таккак размер генома лесных и полевых мышей составляет 8,3—9,1 пг(Gamperl et al., 1982).В отличие от родоспецифичного EcoRI-повтора количестводиспергированных повторяющихся последовательностей длиной1,35 тпн, идентифицированных в геномах лесных мышей ЗападнойЕвропы (Cooke, 1975), а также домовой мыши и крыс(Brown, Dover, 1979, 1981; Hirning et el., 1989; Gamperi et al.,1982; Miklos et al., 1980) (т. е. специфичных, очевидно, для тактсона более высокого ранга), в разных видах отличается. В геномахS. flavicollls, S. sylvaticus, S. uralensis оно максимально и составляет1,8—2,0 %, A. peninsulae — значительно ниже (не выше0,5 %), а у A. speciosus и A. agrarius этот повтор не обнаруживаетсявообще или представлен минимальным количеством копий (регистрациякоторых невозможна из-за ограничений в чувствительностиметода). По имеющимся в литературе сведениям (Brown, Dover,1981), он отсутствует в EcoRI-гидролизатах ДНК A. mystacinus(горная малоазийская мышь) и европейских форм A. agrarius.Максимальная частота повторяемости 1,35 тпн EcoRI-последовательностисоставляет (3—6)х10 4на геном. В яДНК других гры-20