ÐÐСÐЫРРÐÐÐÐÐЫРÐЫШРÐолекÑлÑÑно-генеÑиÑеÑкие ...
ÐÐСÐЫРРÐÐÐÐÐЫРÐЫШРÐолекÑлÑÑно-генеÑиÑеÑкие ... ÐÐСÐЫРРÐÐÐÐÐЫРÐЫШРÐолекÑлÑÑно-генеÑиÑеÑкие ...
Молекулярная эволюция, филогения и систематика по данным вариабельности...характере замен в быстро эволюционирующих последовательностяхДНК. Однако относительная насыщенность даже наиболеевариабельной третьей позиции кодона транзициями, трансверсиямии гомоплазиями характерна только для внешней группы.Более того, именно в третьей позиции кодона локализованобольшинство филогенетически информативных сайтов: 82,2 %(240 из 292). Поэтому филогенетические реконструкции матриархальныхсвязей мы также проводили по данным, учитывающимвсе замены во всех позициях кодона.Время дивергенции разных таксонов устанавливали по даннымдифференциации гаплотипов гена цитохрома b мтДНК, эво-•люционирующего, в отличие от других генов митохондриальногогенома, примерно с равными скоростями в различных родахMurinae (Robinson et al., 1998). Из палеонтологических данных вкачестве калибровочной выбрана точка расхождения S. mystacimis(подрод Karstomys) с остальными видами Sylvaemus, насчитывающаяпримерно 7 млн лет (Michaux et al., 1997). Основываясь наэтих данных, а также полученных нами оценках дивергенцииA. mystacimis с видами подрода Sylvaemus (17,8 %), мы обнаружили,что молекулярная эволюция у лесных мышей шла со скоростью2,54 % нуклеотидных замен за 1 млн лет. Это полностью соответствуетоценке молекулярных часов для мтДНК млекопитающих:примерно 2,5 % дивергенции нуклеотидов за 1 млн лет(Irwin et al., 1991). Таким образом, из наших данных следует, чтовидообразование внутри подрода Sylvaemus происходило в период1,2—5,7 млн лет назад, т. е. в плиоцене—плейстоцене, а его дивергенцияс родом Apodemus насчитывает более 7,5 млн лет раздельнойэволюции, т. е. берет начало еще с миоцена. Эти данные уточняютпалеонтологические сведения, которые датируют становлениезападнопалеарктического рода лесных мышей плейстоценом(Громов, 1981). Действительно, если находки современных видоврода Sylvaemus датируются ранним плейстоценом, начало их дивергенциидолжно быть раньше — в древнем плейстоцене—плиоцене.Аналогичные оценки эволюционного возраста рода Sylvaemusбыли получены нами ранее (Челомина и др., 1998а; Serizawaet al., 2000) и подтверждены в ряде других исследований (Martinet al., 2000; Michaux et al., 2002). Что касается группы видов, радиировавшихот S. sylvaticus, они, вероятнее всего, действительноимеют плейстоценовое происхождение. Это подтверждается выво-123
- Page 73 and 74: ГЛАВА 1группировок
- Page 75 and 76: ГЛАВА 1С помощью ме
- Page 77 and 78: ГЛАВА 1считают, что
- Page 79 and 80: ГЛАВА Iление низком
- Page 81 and 82: ГЛАВА 1шей (Pietras et al.,
- Page 84: Молекулярная эволю
- Page 87 and 88: ГЛАВА 2МОЛЕКУЛЯРНА
- Page 89: ГЛАВА 2гибридизаци
- Page 92: Молекулярная эволю
- Page 97 and 98: ГЛАВА 2обычно менее
- Page 99: ГЛАВА 2мтДНК, может
- Page 103 and 104: ГЛАВА 2(Aquadro, Greenberg, 19
- Page 105 and 106: ГЛАВА 2значение ген
- Page 107 and 108: ГЛАВА 2подрод Sylvaemus
- Page 109: ГЛАВА 22.3. Филогенет
- Page 114 and 115: Молекулярная эволю
- Page 116 and 117: Молекулярная эволю
- Page 118 and 119: Молекулярная эволю
- Page 120 and 121: Молекулярная эволю
- Page 125: ГЛАВА 2(HI=0,1124). Однак
- Page 128: Молекулярная эволю
- Page 132 and 133: [филогенетических
- Page 134 and 135: Молекулярная эволю
- Page 136 and 137: ГЛАВА 3ВНУТРИВИДОВ
- Page 138 and 139: Внутривидовая гене
- Page 140: Внутривидовая гене
- Page 146: Внутривидовая гене
- Page 150 and 151: Внутривидовая гене
- Page 152: Внутривидовая гене
- Page 155: ГЛАВА 3сток генома,
- Page 162 and 163: Внутривидовая гене
- Page 164 and 165: ные), так и у примат
- Page 166 and 167: ском, экологическо
- Page 168 and 169: результаты, гипоте
- Page 170 and 171: стоятельство, что р
Молекулярная эволюция, филогения и систематика по данным вариабельности...характере замен в быстро эволюционирующих последовательностяхДНК. Однако относительная насыщенность даже наиболеевариабельной третьей позиции кодона транзициями, трансверсиямии гомоплазиями характерна только для внешней группы.Более того, именно в третьей позиции кодона локализованобольшинство филогенетически информативных сайтов: 82,2 %(240 из 292). Поэтому филогенетические реконструкции матриархальныхсвязей мы также проводили по данным, учитывающимвсе замены во всех позициях кодона.Время дивергенции разных таксонов устанавливали по даннымдифференциации гаплотипов гена цитохрома b мтДНК, эво-•люционирующего, в отличие от других генов митохондриальногогенома, примерно с равными скоростями в различных родахMurinae (Robinson et al., 1998). Из палеонтологических данных вкачестве калибровочной выбрана точка расхождения S. mystacimis(подрод Karstomys) с остальными видами Sylvaemus, насчитывающаяпримерно 7 млн лет (Michaux et al., 1997). Основываясь наэтих данных, а также полученных нами оценках дивергенцииA. mystacimis с видами подрода Sylvaemus (17,8 %), мы обнаружили,что молекулярная эволюция у лесных мышей шла со скоростью2,54 % нуклеотидных замен за 1 млн лет. Это полностью соответствуетоценке молекулярных часов для мтДНК млекопитающих:примерно 2,5 % дивергенции нуклеотидов за 1 млн лет(Irwin et al., 1991). Таким образом, из наших данных следует, чтовидообразование внутри подрода Sylvaemus происходило в период1,2—5,7 млн лет назад, т. е. в плиоцене—плейстоцене, а его дивергенцияс родом Apodemus насчитывает более 7,5 млн лет раздельнойэволюции, т. е. берет начало еще с миоцена. Эти данные уточняютпалеонтологические сведения, которые датируют становлениезападнопалеарктического рода лесных мышей плейстоценом(Громов, 1981). Действительно, если находки современных видоврода Sylvaemus датируются ранним плейстоценом, начало их дивергенциидолжно быть раньше — в древнем плейстоцене—плиоцене.Аналогичные оценки эволюционного возраста рода Sylvaemusбыли получены нами ранее (Челомина и др., 1998а; Serizawaet al., 2000) и подтверждены в ряде других исследований (Martinet al., 2000; Michaux et al., 2002). Что касается группы видов, радиировавшихот S. sylvaticus, они, вероятнее всего, действительноимеют плейстоценовое происхождение. Это подтверждается выво-123