ЛЕСНЫЕ И ПОЛЕВЫЕ МЫШИ Молекулярно-генетические ...

ГЛАВА 2гена IRBP яДНК (Michaux et al., 2002). Таким образом, всеимеющиеся результаты вполне сопоставимы между собой.Из чисто теоретических умозаключений следует, что вряд лиисключение транзиций (даже только в третьей позиции кодона)следует считать оправданным при филогенетических исследованияхданной группы грызунов. Известно, что скорость эволюциимитохондриальной ДНК в среднем на порядок выше, чем ядерной.Именно такое соотношение мы наблюдаем при вычислениигенетических дистанций лесных мышей по данным изменчивостипоследовательностей ядерного и митохондриального генов как всобственной работе, так и в исследованиях других авторов, учитывающихпри определении генетических дистанций все типы заменво всех положениях кодона. Однако это соотношение нарушаетсяпри сравнении таксонов, раположенных на иерархической лестницевыше. Но исключение транзиций не исправляет положения— лишь снижает (хотя и неравномерно) общий уровеньзначений генетических дистанций. В таком случае, действительно,соотношение уровней межвидовой и межродовойдивергенции более адекватно. Поскольку основная наша задачазаключалась в исследовании отношений видов внутри рода,были все основания для использования полного объема полученныхнами данных. Эти рассуждения находят подтверждение врезультатах анализа насыщения мутационных замен в разныхпозициях кодона.Для определения уровней насыщения транзициями и трансверсиямибыли построены графики зависимости между количествоммутационных замен и нескорректированными генетическимидистанциями (рис. 29). Анализ указанной зависимости выявляетотсутствие насыщения не только трансверсиями (Tv), но и транзициями(Ts) во всех позициях кодона гена IRBP яДНК. Слабоенасыщение замен в третьей позиции кодона этого гена отмечаетсяпри сравнении таксонов мышевидных грызунов более высокоготаксономического ранга (Michaux et al., 2002). Уровень гомоплазиинизок во всех положениях кодона, поэтому для филогенетическихпостроений были учтены все эволюционные события(т. е. оба типа замены оснований).Для гена цитохрома b мтДНК Ts и Tv в третьем положениикодона близки к насыщению, уровень гомоплазии выше, чем длягена яДНК. Эта картина вполне соответствует представлениям о122