Молекулярная эволюция, филогения и систематика по данным вариабельности...дона составляет 10 и 23,9 %, втором - 1,4 и 30,6 %, а третьем -88,6 и 45,6 % соответственно. Хотя в обоих случаях наиболее изменчивымии дающими больший филогенетический сигнал являетсятретьи позиции кодонов, наименее изменчива у митохондриальногогена вторая позиция кодона, а у ядерного — первая.Средние отношения Ts/Tv (транзиций/трансверсий) равны 4,5 и5,6 соответственно для ядерного и митохондриального генов присравнении видов, принадлежащих подроду Sylvaemus. Для межподродовыхи межродовых сравнений эти значения существеннониже (1,4—1,9) (табл. 8). Полученные данные вполне сопоставимыс результатами других авторов, исследовавших молекулярные особенностифилогении и эволюции как млекопитающих, включаялесных мышей, так и других животных (Saitou, Nei, 1987; Martinet al., 2000; Шедько, 2002).Таблица 8Генетические дистанции и отношения транзиций к трансверсиям (Ts/Tv)I по данным вариабельности двух белок-кодирующих генов лесных и полевых мышейGenetic distances and transition/transversion relations (Ts/Tv) based on the dataof two wood and field mice genes variationСравниваемыетаксоныTs/TvГен 1RBP яДНКK2P Ts+TvK2PTvГен цитохрома Ь мтДНКK2P Ts+TvK2PTvTs/TvSylvaemus(внутри видов)Sylvaemus (междувидами)Sylvaemus/A. agrariusSylvaemus/A. mystacinusA.agrarius/A. mystacinus9,04,53,70,00291(0,000-0,0078)0,00897(0,0035-0,0132)0,05266(0,0479-0,0574)0,00029(0,000-0,0009)0,00150(0,000-0,0026)0,00176(0,0097-0,0115)0,05067(0,0053-0,1274)0,11306(0,0307-0,1439)0,17697(0,1609-0,1909)0,17813(0,1671-0,1898)0,18451(0,1842-0,1852)0,01036(0,000-0,0289)0,02116(0,0071-0,0279)0,06395(0,0576-0,0726)0,05367(0,0665-0,0756)0,06752(0,0665-0,0685)4,94,61,91,41,5Примечание. К2Р - двупараметрические дистанции Кимуры; в скобкахуказан диапазон изменчивости.119
ГЛАВА 2Последовательности гена IRBP яДНК, в отличие от гена цитохромаb мтДНК, внутри себя содержат полиморфные сайты.У некоторых особей число полиморфных сайтов особенно велико.Например, в геноме одной из мышей вида S. sylvaticus их 7, аS. ponticus — 6. Аналогичная ситуация наблюдалась при изучениигена IRBP яДНК у японской лесной мыши и японской сони(Serizawa et al., 2000). Наиболее вероятно, что данный тип полиморфизмаобязан своим существованием аллельным вариантам,поскольку число типов для каждого гетерозиготного сайта составляетне больше двух, а мутации представлены главным образомсинонимичными традиционными заменами в третьем положениикодона. Конечно, как это отмечалось ранее (Serizawa et al.,2000), нельзя полностью исключить возможности присутствияпсевдогенов, мультикопий данного гена, или наличия артефактов.Так, Дж. Мишо с соавторами (Michaux et al., 2002) полагают, что,вероятнее всего, в работе Я. Мартина с коллегами (Martin et al.,2000) был использован в качестве последовательности гена цитохромаb мтДНК ядерный псевдоген. Заманчивым, с нашей точкизрения, представляется объяснить это явление межвидовой гибридизацией(периодически оспариваемой в связи с запутанностьюсистематики лесных мышей) как первопричиной внутригеномногополиморфизма. Действительно (и мы уже об этом упоминали),для митохондриального генома при скрещивании млекопитающихизвестны примеры замещения одного гаплотипа другимвсего за несколько генераций, причем на переходной стадии геноммитохондрий обладает гетероплазмичностью, т. е. содержаниемразных гаплотипов мтДНК (Hauswirth, Laipis, 1985).Для исследованной группы мышей были вычислены попарныеабсолютные (суммарные и отдельно для замен типа трансверсийи транзиций) и относительные генетические дистанции,скорректированные согласно двупараметрической модели Кимуры(Kimura, 1980), а также гомоплазии. Внутри подрода Sylvaemusотносительные межвидовые генетические дистанции Кимуры составляютв среднем 0,11306 (находясь в пределах 0,03067—0,14398)и 0,00897 (варьируя в диапазоне 0,00351—0,01320) соответственнодля гена цитохрома b мтДНК и гена IRBP яДНК. Для обоих геновэти значения становятся значительно ниже при внутривидовыхсравнениях и существенно выше — при сравнении видовподрода Sylvaemus с A. mystacinus (подрод Karstomys) или A. agrarius120
- Page 3 and 4:
РОССИЙСКАЯ АКАДЕМИ
- Page 5 and 6:
ПредисловиеПосле о
- Page 7 and 8:
кулярно-генетическ
- Page 9 and 10:
витии теории молек
- Page 11:
ГЛАВА 1МОЛЕКУЛЯРНА
- Page 14 and 15:
Молекулярная эволю
- Page 16 and 17:
Молекулярная эволю
- Page 18 and 19:
Молекулярная эволю
- Page 21 and 22:
ГЛАВА 1Dover, 1981) и (2,4-5)
- Page 24 and 25:
Молекулярная эволю
- Page 26 and 27:
Молекулярная эволю
- Page 28 and 29:
Молекулярная эволю
- Page 30 and 31:
Молекулярная эволю
- Page 32:
Молекулярная эволю
- Page 35 and 36:
ГЛАВА 14. Интенсивно
- Page 37 and 38:
ГЛАВА 1детельством
- Page 40 and 41:
Молекулярная эволю
- Page 42 and 43:
Молекулярная эволю
- Page 45 and 46:
ГЛАВА 1ференциация
- Page 47:
ГЛАВА 1Alul-фрагменты
- Page 50 and 51:
Молекулярная эволю
- Page 52 and 53:
Молекулярная эволю
- Page 54 and 55:
^Молекулярная эвол
- Page 56 and 57:
Молекулярная эволю
- Page 58 and 59:
Молекулярная эволю
- Page 62 and 63:
Молекулярная эволю
- Page 64:
Молекулярная эволю
- Page 70 and 71: Молекулярная эволю
- Page 73 and 74: ГЛАВА 1группировок
- Page 75 and 76: ГЛАВА 1С помощью ме
- Page 77 and 78: ГЛАВА 1считают, что
- Page 79 and 80: ГЛАВА Iление низком
- Page 81 and 82: ГЛАВА 1шей (Pietras et al.,
- Page 84: Молекулярная эволю
- Page 87 and 88: ГЛАВА 2МОЛЕКУЛЯРНА
- Page 89: ГЛАВА 2гибридизаци
- Page 92: Молекулярная эволю
- Page 97 and 98: ГЛАВА 2обычно менее
- Page 99: ГЛАВА 2мтДНК, может
- Page 103 and 104: ГЛАВА 2(Aquadro, Greenberg, 19
- Page 105 and 106: ГЛАВА 2значение ген
- Page 107 and 108: ГЛАВА 2подрод Sylvaemus
- Page 109: ГЛАВА 22.3. Филогенет
- Page 114 and 115: Молекулярная эволю
- Page 116 and 117: Молекулярная эволю
- Page 120 and 121: Молекулярная эволю
- Page 122: Молекулярная эволю
- Page 127 and 128: ГЛАВА 2ки и самцы ха
- Page 130: Молекулярная эволю
- Page 133 and 134: ГЛАВА 2теоретическ
- Page 135 and 136: ГЛАВА 2ально, так ка
- Page 137 and 138: ГЛАВА 3лись в начал
- Page 139 and 140: ГЛАВА 3нов, предста
- Page 144: Внутривидовая гене
- Page 149 and 150: ГЛАВА 3Внутривидов
- Page 151 and 152: ГЛАВА 3имеют четкие
- Page 154 and 155: Внутривидовая гене
- Page 159: ГЛАВА 3ных. При анал
- Page 163 and 164: ЗаключениеЗаинтер
- Page 165 and 166: Помимо известного 3
- Page 167 and 168: (по крайней мере, не
- Page 169 and 170:
ных уровнях (морфол
- Page 171 and 172:
Если говорить о мик
- Page 173 and 174:
Список терминовАвт
- Page 175 and 176:
ДНК-полимераза — ф
- Page 177 and 178:
Нейтральная теория
- Page 179 and 180:
Сплайсинг — процес
- Page 181 and 182:
ЛитератураАйяла Ф.,
- Page 183 and 184:
Воронцов Н.Н. Разви
- Page 185 and 186:
Межжерин СВ., Зыков
- Page 187 and 188:
Челомина Г.Н. Эволю
- Page 189 and 190:
Bellinvia E., Munclinger P., Flegr
- Page 191 and 192:
Dobzhansky Th. Genetics and origin
- Page 193 and 194:
ecological genetics of animal speci
- Page 195 and 196:
Makova K.D., Nekrutenko A., Baker R
- Page 197 and 198:
Nishioka T. Genome comparison in th
- Page 199 and 200:
Suzuki H., Wakana S., Yonekawa H. e
- Page 201 and 202:
ОглавлениеПредисл