生物信息技术在宏基因组学的应用 - abc
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宏 转 录 组 研 究 特 定 环 境 特 定 时 期 群 体 细 胞 在 某 功 能 状 态 下 转 录 的 所 有 RNA( 包 括 mRNA 和 非 编 码 RNA) 的 类 型 及 拷 贝 数 。 Poretsky 对 贫 瘠 的 北 太 平 洋 水 域 表 面 的 浮 游 细 菌 种 群 进 行 了 研 究 ,mRNA 数 据 表 明 , 该 群 体 的 微 生 物 白 天 进 行 光 合 作 用 、 氧 化 磷 酸 化 和 C1 化 合 物 的 合 成 代 谢 活 动 , 而 夜 间 则 进 行 细 胞 膜 、 氨 基 酸 和 维 生 素 等 生 物 合 成 活 动 。
宏 蛋 白 质 组 由 Paul 和 Philip 二 人 在 2004 年 首 先 提 出 , 指 在 特 定 时 间 对 微 生 物 群 落 的 所 有 蛋 白 质 组 成 进 行 大 规 模 鉴 定 。 目 前 还 没 有 通 用 的 应 用 于 环 境 样 品 蛋 白 质 提 取 的 方 法 , 特 别 是 从 土 壤 、 海 水 等 复 杂 环 境 样 品 中 提 取 总 蛋 白 还 有 很 大 困 难 。 目 前 的 蛋 白 质 分 离 技 术 仅 能 对 复 杂 环 境 样 品 中 不 到 1% 的 蛋 白 质 进 行 分 析 。
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宏 转 录 组<br />
研 究 特 定 环 境 特 定 时 期 群 体 细 胞 在 某 功 能 状 态 下 转<br />
录 的 所 有 RNA( 包 括 mRNA 和 非 编 码 RNA) 的 类 型 及 拷<br />
贝 数 。<br />
Poretsky 对 贫 瘠 的 北 太 平 洋 水 域 表 面 的 浮 游 细 菌<br />
种 群 进 行 了 研 究 ,mRNA 数 据 表 明 , 该 群 体 的 微 生 物<br />
白 天 进 行 光 合 作 用 、 氧 化 磷 酸 化 和 C1 化 合 物 的 合 成 代<br />
谢 活 动 , 而 夜 间 则 进 行 细 胞 膜 、 氨 基 酸 和 维 生 素 等 生<br />
物 合 成 活 动 。
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